Protein–RNA interactions for Protein: Q60848

Hells, Lymphocyte-specific helicase, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HellsQ60848 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HellsQ60848 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HellsQ60848 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HellsQ60848 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HellsQ60848 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HellsQ60848 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HellsQ60848 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HellsQ60848 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HellsQ60848 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HellsQ60848 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HellsQ60848 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HellsQ60848 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HellsQ60848 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HellsQ60848 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HellsQ60848 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HellsQ60848 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HellsQ60848 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HellsQ60848 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HellsQ60848 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HellsQ60848 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HellsQ60848 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
HellsQ60848 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HellsQ60848 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HellsQ60848 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HellsQ60848 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HellsQ60848 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HellsQ60848 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HellsQ60848 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HellsQ60848 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HellsQ60848 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HellsQ60848 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HellsQ60848 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HellsQ60848 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HellsQ60848 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HellsQ60848 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HellsQ60848 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HellsQ60848 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
HellsQ60848 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HellsQ60848 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HellsQ60848 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HellsQ60848 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HellsQ60848 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HellsQ60848 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HellsQ60848 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HellsQ60848 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HellsQ60848 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HellsQ60848 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HellsQ60848 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HellsQ60848 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HellsQ60848 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HellsQ60848 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HellsQ60848 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HellsQ60848 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HellsQ60848 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HellsQ60848 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HellsQ60848 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HellsQ60848 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HellsQ60848 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HellsQ60848 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HellsQ60848 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HellsQ60848 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HellsQ60848 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HellsQ60848 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HellsQ60848 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HellsQ60848 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HellsQ60848 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HellsQ60848 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
HellsQ60848 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HellsQ60848 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HellsQ60848 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HellsQ60848 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HellsQ60848 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HellsQ60848 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HellsQ60848 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HellsQ60848 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HellsQ60848 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HellsQ60848 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HellsQ60848 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HellsQ60848 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HellsQ60848 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HellsQ60848 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HellsQ60848 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HellsQ60848 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HellsQ60848 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
HellsQ60848 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HellsQ60848 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HellsQ60848 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HellsQ60848 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HellsQ60848 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HellsQ60848 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HellsQ60848 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HellsQ60848 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HellsQ60848 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HellsQ60848 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HellsQ60848 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HellsQ60848 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HellsQ60848 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HellsQ60848 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HellsQ60848 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HellsQ60848 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms