Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ItgaeQ60677 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ItgaeQ60677 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ItgaeQ60677 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ItgaeQ60677 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ItgaeQ60677 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ItgaeQ60677 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ItgaeQ60677 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ItgaeQ60677 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ItgaeQ60677 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ItgaeQ60677 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ItgaeQ60677 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ItgaeQ60677 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ItgaeQ60677 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ItgaeQ60677 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ItgaeQ60677 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ItgaeQ60677 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ItgaeQ60677 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ItgaeQ60677 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ItgaeQ60677 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ItgaeQ60677 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ItgaeQ60677 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ItgaeQ60677 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ItgaeQ60677 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ItgaeQ60677 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ItgaeQ60677 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ItgaeQ60677 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ItgaeQ60677 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ItgaeQ60677 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ItgaeQ60677 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ItgaeQ60677 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ItgaeQ60677 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ItgaeQ60677 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ItgaeQ60677 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ItgaeQ60677 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ItgaeQ60677 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ItgaeQ60677 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ItgaeQ60677 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ItgaeQ60677 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ItgaeQ60677 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ItgaeQ60677 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ItgaeQ60677 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ItgaeQ60677 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ItgaeQ60677 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ItgaeQ60677 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ItgaeQ60677 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ItgaeQ60677 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ItgaeQ60677 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ItgaeQ60677 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ItgaeQ60677 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ItgaeQ60677 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ItgaeQ60677 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ItgaeQ60677 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ItgaeQ60677 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ItgaeQ60677 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ItgaeQ60677 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ItgaeQ60677 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ItgaeQ60677 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ItgaeQ60677 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ItgaeQ60677 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ItgaeQ60677 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ItgaeQ60677 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ItgaeQ60677 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ItgaeQ60677 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ItgaeQ60677 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ItgaeQ60677 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ItgaeQ60677 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ItgaeQ60677 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ItgaeQ60677 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ItgaeQ60677 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ItgaeQ60677 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ItgaeQ60677 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ItgaeQ60677 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ItgaeQ60677 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ItgaeQ60677 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ItgaeQ60677 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ItgaeQ60677 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ItgaeQ60677 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ItgaeQ60677 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ItgaeQ60677 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ItgaeQ60677 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ItgaeQ60677 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ItgaeQ60677 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ItgaeQ60677 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ItgaeQ60677 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ItgaeQ60677 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ItgaeQ60677 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ItgaeQ60677 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ItgaeQ60677 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ItgaeQ60677 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ItgaeQ60677 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ItgaeQ60677 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ItgaeQ60677 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ItgaeQ60677 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ItgaeQ60677 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ItgaeQ60677 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ItgaeQ60677 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ItgaeQ60677 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ItgaeQ60677 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ItgaeQ60677 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms