Protein–RNA interactions for Protein: Q5U901

Cpa6, Carboxypeptidase A6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa6Q5U901 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cpa6Q5U901 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cpa6Q5U901 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cpa6Q5U901 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cpa6Q5U901 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cpa6Q5U901 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpa6Q5U901 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpa6Q5U901 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpa6Q5U901 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpa6Q5U901 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpa6Q5U901 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpa6Q5U901 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpa6Q5U901 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpa6Q5U901 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpa6Q5U901 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpa6Q5U901 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cpa6Q5U901 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cpa6Q5U901 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cpa6Q5U901 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cpa6Q5U901 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cpa6Q5U901 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpa6Q5U901 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpa6Q5U901 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpa6Q5U901 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpa6Q5U901 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpa6Q5U901 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpa6Q5U901 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpa6Q5U901 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpa6Q5U901 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpa6Q5U901 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpa6Q5U901 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpa6Q5U901 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpa6Q5U901 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpa6Q5U901 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpa6Q5U901 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpa6Q5U901 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cpa6Q5U901 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cpa6Q5U901 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpa6Q5U901 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpa6Q5U901 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpa6Q5U901 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpa6Q5U901 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpa6Q5U901 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpa6Q5U901 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpa6Q5U901 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpa6Q5U901 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpa6Q5U901 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpa6Q5U901 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpa6Q5U901 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpa6Q5U901 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpa6Q5U901 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpa6Q5U901 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpa6Q5U901 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpa6Q5U901 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpa6Q5U901 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpa6Q5U901 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpa6Q5U901 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpa6Q5U901 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpa6Q5U901 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpa6Q5U901 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpa6Q5U901 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpa6Q5U901 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpa6Q5U901 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpa6Q5U901 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpa6Q5U901 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpa6Q5U901 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpa6Q5U901 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpa6Q5U901 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpa6Q5U901 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpa6Q5U901 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpa6Q5U901 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpa6Q5U901 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpa6Q5U901 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpa6Q5U901 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpa6Q5U901 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpa6Q5U901 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpa6Q5U901 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpa6Q5U901 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpa6Q5U901 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpa6Q5U901 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpa6Q5U901 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms