Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc5a6Q5U4D8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc5a6Q5U4D8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc5a6Q5U4D8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc5a6Q5U4D8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc5a6Q5U4D8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc5a6Q5U4D8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc5a6Q5U4D8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc5a6Q5U4D8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc5a6Q5U4D8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a6Q5U4D8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a6Q5U4D8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a6Q5U4D8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a6Q5U4D8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc5a6Q5U4D8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc5a6Q5U4D8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc5a6Q5U4D8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc5a6Q5U4D8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc5a6Q5U4D8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc5a6Q5U4D8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc5a6Q5U4D8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc5a6Q5U4D8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc5a6Q5U4D8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc5a6Q5U4D8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc5a6Q5U4D8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc5a6Q5U4D8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a6Q5U4D8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a6Q5U4D8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a6Q5U4D8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a6Q5U4D8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a6Q5U4D8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a6Q5U4D8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a6Q5U4D8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a6Q5U4D8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a6Q5U4D8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc5a6Q5U4D8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc5a6Q5U4D8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc5a6Q5U4D8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc5a6Q5U4D8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc5a6Q5U4D8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc5a6Q5U4D8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc5a6Q5U4D8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc5a6Q5U4D8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc5a6Q5U4D8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc5a6Q5U4D8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc5a6Q5U4D8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc5a6Q5U4D8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc5a6Q5U4D8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc5a6Q5U4D8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc5a6Q5U4D8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc5a6Q5U4D8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc5a6Q5U4D8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc5a6Q5U4D8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc5a6Q5U4D8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc5a6Q5U4D8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc5a6Q5U4D8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc5a6Q5U4D8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc5a6Q5U4D8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc5a6Q5U4D8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc5a6Q5U4D8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc5a6Q5U4D8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc5a6Q5U4D8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc5a6Q5U4D8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc5a6Q5U4D8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc5a6Q5U4D8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc5a6Q5U4D8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc5a6Q5U4D8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc5a6Q5U4D8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc5a6Q5U4D8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc5a6Q5U4D8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc5a6Q5U4D8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc5a6Q5U4D8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc5a6Q5U4D8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc5a6Q5U4D8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc5a6Q5U4D8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc5a6Q5U4D8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc5a6Q5U4D8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc5a6Q5U4D8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc5a6Q5U4D8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc5a6Q5U4D8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc5a6Q5U4D8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc5a6Q5U4D8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc5a6Q5U4D8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc5a6Q5U4D8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc5a6Q5U4D8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc5a6Q5U4D8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc5a6Q5U4D8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Slc5a6Q5U4D8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Slc5a6Q5U4D8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Slc5a6Q5U4D8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Slc5a6Q5U4D8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Slc5a6Q5U4D8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc5a6Q5U4D8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc5a6Q5U4D8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc5a6Q5U4D8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Slc5a6Q5U4D8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc5a6Q5U4D8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Slc5a6Q5U4D8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc5a6Q5U4D8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc5a6Q5U4D8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms