Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tsr1Q5SWD9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tsr1Q5SWD9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsr1Q5SWD9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsr1Q5SWD9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsr1Q5SWD9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tsr1Q5SWD9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tsr1Q5SWD9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsr1Q5SWD9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsr1Q5SWD9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsr1Q5SWD9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsr1Q5SWD9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsr1Q5SWD9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsr1Q5SWD9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsr1Q5SWD9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsr1Q5SWD9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsr1Q5SWD9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsr1Q5SWD9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsr1Q5SWD9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsr1Q5SWD9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsr1Q5SWD9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsr1Q5SWD9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsr1Q5SWD9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsr1Q5SWD9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsr1Q5SWD9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsr1Q5SWD9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsr1Q5SWD9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsr1Q5SWD9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsr1Q5SWD9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsr1Q5SWD9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsr1Q5SWD9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsr1Q5SWD9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsr1Q5SWD9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsr1Q5SWD9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tsr1Q5SWD9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tsr1Q5SWD9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tsr1Q5SWD9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tsr1Q5SWD9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsr1Q5SWD9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsr1Q5SWD9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsr1Q5SWD9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsr1Q5SWD9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsr1Q5SWD9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsr1Q5SWD9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsr1Q5SWD9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tsr1Q5SWD9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tsr1Q5SWD9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tsr1Q5SWD9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tsr1Q5SWD9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tsr1Q5SWD9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsr1Q5SWD9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsr1Q5SWD9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsr1Q5SWD9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsr1Q5SWD9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsr1Q5SWD9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsr1Q5SWD9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsr1Q5SWD9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsr1Q5SWD9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsr1Q5SWD9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsr1Q5SWD9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsr1Q5SWD9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tsr1Q5SWD9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tsr1Q5SWD9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tsr1Q5SWD9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tsr1Q5SWD9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tsr1Q5SWD9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tsr1Q5SWD9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tsr1Q5SWD9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tsr1Q5SWD9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tsr1Q5SWD9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tsr1Q5SWD9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tsr1Q5SWD9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tsr1Q5SWD9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tsr1Q5SWD9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tsr1Q5SWD9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tsr1Q5SWD9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tsr1Q5SWD9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tsr1Q5SWD9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tsr1Q5SWD9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tsr1Q5SWD9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tsr1Q5SWD9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tsr1Q5SWD9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tsr1Q5SWD9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tsr1Q5SWD9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tsr1Q5SWD9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tsr1Q5SWD9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tsr1Q5SWD9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tsr1Q5SWD9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tsr1Q5SWD9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tsr1Q5SWD9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tsr1Q5SWD9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tsr1Q5SWD9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tsr1Q5SWD9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tsr1Q5SWD9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tsr1Q5SWD9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tsr1Q5SWD9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tsr1Q5SWD9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tsr1Q5SWD9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms