Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW19

Cluh, Clustered mitochondria protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluhQ5SW19 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CluhQ5SW19 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CluhQ5SW19 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CluhQ5SW19 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CluhQ5SW19 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CluhQ5SW19 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CluhQ5SW19 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CluhQ5SW19 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CluhQ5SW19 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CluhQ5SW19 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CluhQ5SW19 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CluhQ5SW19 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CluhQ5SW19 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CluhQ5SW19 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CluhQ5SW19 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CluhQ5SW19 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CluhQ5SW19 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CluhQ5SW19 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CluhQ5SW19 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CluhQ5SW19 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CluhQ5SW19 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CluhQ5SW19 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CluhQ5SW19 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CluhQ5SW19 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CluhQ5SW19 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CluhQ5SW19 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CluhQ5SW19 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CluhQ5SW19 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CluhQ5SW19 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CluhQ5SW19 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CluhQ5SW19 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CluhQ5SW19 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CluhQ5SW19 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CluhQ5SW19 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CluhQ5SW19 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CluhQ5SW19 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CluhQ5SW19 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CluhQ5SW19 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CluhQ5SW19 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CluhQ5SW19 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CluhQ5SW19 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CluhQ5SW19 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CluhQ5SW19 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CluhQ5SW19 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CluhQ5SW19 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CluhQ5SW19 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CluhQ5SW19 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CluhQ5SW19 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CluhQ5SW19 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CluhQ5SW19 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CluhQ5SW19 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CluhQ5SW19 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CluhQ5SW19 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CluhQ5SW19 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CluhQ5SW19 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CluhQ5SW19 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CluhQ5SW19 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CluhQ5SW19 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CluhQ5SW19 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CluhQ5SW19 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CluhQ5SW19 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CluhQ5SW19 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CluhQ5SW19 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CluhQ5SW19 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CluhQ5SW19 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CluhQ5SW19 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CluhQ5SW19 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CluhQ5SW19 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CluhQ5SW19 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CluhQ5SW19 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CluhQ5SW19 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CluhQ5SW19 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CluhQ5SW19 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CluhQ5SW19 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CluhQ5SW19 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CluhQ5SW19 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CluhQ5SW19 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CluhQ5SW19 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CluhQ5SW19 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CluhQ5SW19 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CluhQ5SW19 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CluhQ5SW19 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CluhQ5SW19 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CluhQ5SW19 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CluhQ5SW19 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CluhQ5SW19 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CluhQ5SW19 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CluhQ5SW19 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CluhQ5SW19 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CluhQ5SW19 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CluhQ5SW19 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CluhQ5SW19 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CluhQ5SW19 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CluhQ5SW19 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CluhQ5SW19 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CluhQ5SW19 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CluhQ5SW19 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CluhQ5SW19 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CluhQ5SW19 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CluhQ5SW19 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms