Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam71bQ5STT6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam71bQ5STT6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam71bQ5STT6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam71bQ5STT6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam71bQ5STT6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam71bQ5STT6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam71bQ5STT6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam71bQ5STT6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam71bQ5STT6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam71bQ5STT6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam71bQ5STT6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam71bQ5STT6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam71bQ5STT6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam71bQ5STT6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam71bQ5STT6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam71bQ5STT6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam71bQ5STT6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam71bQ5STT6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam71bQ5STT6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam71bQ5STT6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam71bQ5STT6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam71bQ5STT6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam71bQ5STT6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam71bQ5STT6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam71bQ5STT6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam71bQ5STT6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam71bQ5STT6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam71bQ5STT6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam71bQ5STT6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam71bQ5STT6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam71bQ5STT6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam71bQ5STT6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam71bQ5STT6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam71bQ5STT6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam71bQ5STT6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam71bQ5STT6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam71bQ5STT6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam71bQ5STT6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam71bQ5STT6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam71bQ5STT6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam71bQ5STT6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam71bQ5STT6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam71bQ5STT6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam71bQ5STT6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam71bQ5STT6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam71bQ5STT6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam71bQ5STT6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam71bQ5STT6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam71bQ5STT6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam71bQ5STT6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam71bQ5STT6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam71bQ5STT6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam71bQ5STT6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam71bQ5STT6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam71bQ5STT6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam71bQ5STT6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam71bQ5STT6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam71bQ5STT6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam71bQ5STT6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam71bQ5STT6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam71bQ5STT6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam71bQ5STT6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam71bQ5STT6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam71bQ5STT6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam71bQ5STT6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam71bQ5STT6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam71bQ5STT6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam71bQ5STT6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam71bQ5STT6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam71bQ5STT6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam71bQ5STT6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam71bQ5STT6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam71bQ5STT6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam71bQ5STT6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam71bQ5STT6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam71bQ5STT6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam71bQ5STT6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam71bQ5STT6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam71bQ5STT6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam71bQ5STT6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam71bQ5STT6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam71bQ5STT6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Fam71bQ5STT6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam71bQ5STT6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam71bQ5STT6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam71bQ5STT6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam71bQ5STT6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam71bQ5STT6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam71bQ5STT6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam71bQ5STT6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam71bQ5STT6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam71bQ5STT6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam71bQ5STT6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam71bQ5STT6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam71bQ5STT6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Fam71bQ5STT6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Fam71bQ5STT6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fam71bQ5STT6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam71bQ5STT6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms