Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQX6

Cyfip2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyfip2Q5SQX6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyfip2Q5SQX6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyfip2Q5SQX6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyfip2Q5SQX6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyfip2Q5SQX6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyfip2Q5SQX6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyfip2Q5SQX6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyfip2Q5SQX6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyfip2Q5SQX6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyfip2Q5SQX6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyfip2Q5SQX6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyfip2Q5SQX6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyfip2Q5SQX6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyfip2Q5SQX6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyfip2Q5SQX6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyfip2Q5SQX6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyfip2Q5SQX6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyfip2Q5SQX6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyfip2Q5SQX6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyfip2Q5SQX6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyfip2Q5SQX6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyfip2Q5SQX6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyfip2Q5SQX6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyfip2Q5SQX6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyfip2Q5SQX6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyfip2Q5SQX6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyfip2Q5SQX6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyfip2Q5SQX6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyfip2Q5SQX6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyfip2Q5SQX6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyfip2Q5SQX6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyfip2Q5SQX6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyfip2Q5SQX6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyfip2Q5SQX6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyfip2Q5SQX6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyfip2Q5SQX6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyfip2Q5SQX6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyfip2Q5SQX6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyfip2Q5SQX6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyfip2Q5SQX6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyfip2Q5SQX6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyfip2Q5SQX6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyfip2Q5SQX6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyfip2Q5SQX6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyfip2Q5SQX6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyfip2Q5SQX6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyfip2Q5SQX6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyfip2Q5SQX6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyfip2Q5SQX6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyfip2Q5SQX6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyfip2Q5SQX6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyfip2Q5SQX6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyfip2Q5SQX6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyfip2Q5SQX6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyfip2Q5SQX6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyfip2Q5SQX6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyfip2Q5SQX6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyfip2Q5SQX6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cyfip2Q5SQX6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyfip2Q5SQX6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyfip2Q5SQX6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyfip2Q5SQX6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyfip2Q5SQX6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyfip2Q5SQX6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyfip2Q5SQX6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyfip2Q5SQX6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyfip2Q5SQX6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyfip2Q5SQX6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyfip2Q5SQX6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyfip2Q5SQX6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyfip2Q5SQX6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyfip2Q5SQX6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyfip2Q5SQX6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyfip2Q5SQX6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyfip2Q5SQX6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyfip2Q5SQX6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyfip2Q5SQX6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyfip2Q5SQX6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyfip2Q5SQX6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyfip2Q5SQX6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyfip2Q5SQX6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyfip2Q5SQX6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyfip2Q5SQX6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyfip2Q5SQX6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyfip2Q5SQX6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyfip2Q5SQX6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyfip2Q5SQX6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyfip2Q5SQX6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cyfip2Q5SQX6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cyfip2Q5SQX6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cyfip2Q5SQX6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyfip2Q5SQX6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyfip2Q5SQX6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyfip2Q5SQX6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyfip2Q5SQX6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyfip2Q5SQX6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyfip2Q5SQX6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyfip2Q5SQX6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyfip2Q5SQX6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyfip2Q5SQX6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 704.6 ms