Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPW0

Vps54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps54Q5SPW0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vps54Q5SPW0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vps54Q5SPW0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vps54Q5SPW0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vps54Q5SPW0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vps54Q5SPW0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vps54Q5SPW0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vps54Q5SPW0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vps54Q5SPW0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vps54Q5SPW0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vps54Q5SPW0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vps54Q5SPW0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vps54Q5SPW0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vps54Q5SPW0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vps54Q5SPW0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vps54Q5SPW0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vps54Q5SPW0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vps54Q5SPW0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vps54Q5SPW0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vps54Q5SPW0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Vps54Q5SPW0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Vps54Q5SPW0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vps54Q5SPW0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vps54Q5SPW0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vps54Q5SPW0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vps54Q5SPW0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vps54Q5SPW0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vps54Q5SPW0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vps54Q5SPW0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vps54Q5SPW0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vps54Q5SPW0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Vps54Q5SPW0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Vps54Q5SPW0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vps54Q5SPW0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vps54Q5SPW0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vps54Q5SPW0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vps54Q5SPW0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vps54Q5SPW0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vps54Q5SPW0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vps54Q5SPW0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vps54Q5SPW0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vps54Q5SPW0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vps54Q5SPW0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vps54Q5SPW0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vps54Q5SPW0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vps54Q5SPW0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vps54Q5SPW0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vps54Q5SPW0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Vps54Q5SPW0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Vps54Q5SPW0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Vps54Q5SPW0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Vps54Q5SPW0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vps54Q5SPW0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vps54Q5SPW0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vps54Q5SPW0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vps54Q5SPW0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vps54Q5SPW0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vps54Q5SPW0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vps54Q5SPW0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vps54Q5SPW0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Vps54Q5SPW0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vps54Q5SPW0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vps54Q5SPW0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vps54Q5SPW0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vps54Q5SPW0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vps54Q5SPW0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vps54Q5SPW0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vps54Q5SPW0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Vps54Q5SPW0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Vps54Q5SPW0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps54Q5SPW0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps54Q5SPW0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps54Q5SPW0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps54Q5SPW0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps54Q5SPW0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps54Q5SPW0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vps54Q5SPW0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vps54Q5SPW0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vps54Q5SPW0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vps54Q5SPW0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vps54Q5SPW0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vps54Q5SPW0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vps54Q5SPW0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vps54Q5SPW0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vps54Q5SPW0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vps54Q5SPW0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vps54Q5SPW0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Vps54Q5SPW0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vps54Q5SPW0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vps54Q5SPW0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vps54Q5SPW0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vps54Q5SPW0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vps54Q5SPW0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vps54Q5SPW0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vps54Q5SPW0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vps54Q5SPW0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Vps54Q5SPW0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vps54Q5SPW0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vps54Q5SPW0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vps54Q5SPW0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms