Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc88aQ5SNZ0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc88aQ5SNZ0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc88aQ5SNZ0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc88aQ5SNZ0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc88aQ5SNZ0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc88aQ5SNZ0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc88aQ5SNZ0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc88aQ5SNZ0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc88aQ5SNZ0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc88aQ5SNZ0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc88aQ5SNZ0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc88aQ5SNZ0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc88aQ5SNZ0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc88aQ5SNZ0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc88aQ5SNZ0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc88aQ5SNZ0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc88aQ5SNZ0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc88aQ5SNZ0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc88aQ5SNZ0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc88aQ5SNZ0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc88aQ5SNZ0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc88aQ5SNZ0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc88aQ5SNZ0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc88aQ5SNZ0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc88aQ5SNZ0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc88aQ5SNZ0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc88aQ5SNZ0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc88aQ5SNZ0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc88aQ5SNZ0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc88aQ5SNZ0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc88aQ5SNZ0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc88aQ5SNZ0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc88aQ5SNZ0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc88aQ5SNZ0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc88aQ5SNZ0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc88aQ5SNZ0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc88aQ5SNZ0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc88aQ5SNZ0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc88aQ5SNZ0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccdc88aQ5SNZ0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc88aQ5SNZ0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc88aQ5SNZ0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc88aQ5SNZ0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc88aQ5SNZ0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc88aQ5SNZ0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc88aQ5SNZ0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc88aQ5SNZ0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc88aQ5SNZ0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc88aQ5SNZ0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc88aQ5SNZ0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc88aQ5SNZ0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc88aQ5SNZ0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc88aQ5SNZ0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc88aQ5SNZ0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc88aQ5SNZ0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc88aQ5SNZ0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc88aQ5SNZ0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc88aQ5SNZ0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc88aQ5SNZ0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc88aQ5SNZ0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc88aQ5SNZ0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc88aQ5SNZ0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc88aQ5SNZ0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc88aQ5SNZ0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc88aQ5SNZ0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc88aQ5SNZ0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc88aQ5SNZ0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc88aQ5SNZ0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc88aQ5SNZ0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc88aQ5SNZ0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc88aQ5SNZ0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc88aQ5SNZ0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc88aQ5SNZ0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc88aQ5SNZ0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc88aQ5SNZ0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms