Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI4

Pkdcc, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkdccQ5RJI4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,16■■□□□ 1,3
PkdccQ5RJI4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
PkdccQ5RJI4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,16■■□□□ 1,3
PkdccQ5RJI4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
PkdccQ5RJI4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23,15■■□□□ 1,3
PkdccQ5RJI4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
PkdccQ5RJI4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
PkdccQ5RJI4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
PkdccQ5RJI4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23,14■■□□□ 1,29
PkdccQ5RJI4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
PkdccQ5RJI4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
PkdccQ5RJI4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,13■■□□□ 1,29
PkdccQ5RJI4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
PkdccQ5RJI4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23,12■■□□□ 1,29
PkdccQ5RJI4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
PkdccQ5RJI4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
PkdccQ5RJI4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23,12■■□□□ 1,29
PkdccQ5RJI4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23,12■■□□□ 1,29
PkdccQ5RJI4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
PkdccQ5RJI4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
PkdccQ5RJI4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23,11■■□□□ 1,29
PkdccQ5RJI4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23,11■■□□□ 1,29
PkdccQ5RJI4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,11■■□□□ 1,29
PkdccQ5RJI4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
PkdccQ5RJI4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
PkdccQ5RJI4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23,1■■□□□ 1,29
PkdccQ5RJI4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
PkdccQ5RJI4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,1■■□□□ 1,29
PkdccQ5RJI4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,1■■□□□ 1,29
PkdccQ5RJI4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
PkdccQ5RJI4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23,09■■□□□ 1,29
PkdccQ5RJI4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23,09■■□□□ 1,29
PkdccQ5RJI4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
PkdccQ5RJI4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
PkdccQ5RJI4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
PkdccQ5RJI4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,28
PkdccQ5RJI4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
PkdccQ5RJI4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23,07■■□□□ 1,28
PkdccQ5RJI4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23,07■■□□□ 1,28
PkdccQ5RJI4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
PkdccQ5RJI4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
PkdccQ5RJI4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
PkdccQ5RJI4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,06■■□□□ 1,28
PkdccQ5RJI4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
PkdccQ5RJI4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23,06■■□□□ 1,28
PkdccQ5RJI4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23,06■■□□□ 1,28
PkdccQ5RJI4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,06■■□□□ 1,28
PkdccQ5RJI4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
PkdccQ5RJI4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23,05■■□□□ 1,28
PkdccQ5RJI4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
PkdccQ5RJI4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
PkdccQ5RJI4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23,04■■□□□ 1,28
PkdccQ5RJI4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
PkdccQ5RJI4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23,04■■□□□ 1,28
PkdccQ5RJI4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23,04■■□□□ 1,28
PkdccQ5RJI4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
PkdccQ5RJI4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,03■■□□□ 1,28
PkdccQ5RJI4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
PkdccQ5RJI4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23,02■■□□□ 1,28
PkdccQ5RJI4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
PkdccQ5RJI4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
PkdccQ5RJI4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23,02■■□□□ 1,28
PkdccQ5RJI4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,02■■□□□ 1,28
PkdccQ5RJI4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,02■■□□□ 1,28
PkdccQ5RJI4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,02■■□□□ 1,28
PkdccQ5RJI4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,01■■□□□ 1,27
PkdccQ5RJI4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23,01■■□□□ 1,27
PkdccQ5RJI4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
PkdccQ5RJI4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23,01■■□□□ 1,27
PkdccQ5RJI4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
PkdccQ5RJI4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
PkdccQ5RJI4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
PkdccQ5RJI4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
PkdccQ5RJI4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
PkdccQ5RJI4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
PkdccQ5RJI4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
PkdccQ5RJI4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1,27
PkdccQ5RJI4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
PkdccQ5RJI4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
PkdccQ5RJI4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
PkdccQ5RJI4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
PkdccQ5RJI4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
PkdccQ5RJI4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
PkdccQ5RJI4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
PkdccQ5RJI4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22,98■■□□□ 1,27
PkdccQ5RJI4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
PkdccQ5RJI4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22,98■■□□□ 1,27
PkdccQ5RJI4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22,98■■□□□ 1,27
PkdccQ5RJI4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22,98■■□□□ 1,27
PkdccQ5RJI4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22,98■■□□□ 1,27
PkdccQ5RJI4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22,98■■□□□ 1,27
PkdccQ5RJI4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,98■■□□□ 1,27
PkdccQ5RJI4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
PkdccQ5RJI4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
PkdccQ5RJI4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
PkdccQ5RJI4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22,97■■□□□ 1,27
PkdccQ5RJI4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
PkdccQ5RJI4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
PkdccQ5RJI4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
PkdccQ5RJI4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23,7 ms