Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJF7

Cacna2d4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d4Q5RJF7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cacna2d4Q5RJF7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cacna2d4Q5RJF7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cacna2d4Q5RJF7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cacna2d4Q5RJF7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cacna2d4Q5RJF7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cacna2d4Q5RJF7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cacna2d4Q5RJF7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cacna2d4Q5RJF7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cacna2d4Q5RJF7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cacna2d4Q5RJF7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacna2d4Q5RJF7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacna2d4Q5RJF7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacna2d4Q5RJF7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cacna2d4Q5RJF7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cacna2d4Q5RJF7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cacna2d4Q5RJF7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cacna2d4Q5RJF7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cacna2d4Q5RJF7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cacna2d4Q5RJF7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cacna2d4Q5RJF7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Cacna2d4Q5RJF7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cacna2d4Q5RJF7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cacna2d4Q5RJF7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cacna2d4Q5RJF7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cacna2d4Q5RJF7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cacna2d4Q5RJF7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacna2d4Q5RJF7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacna2d4Q5RJF7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacna2d4Q5RJF7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacna2d4Q5RJF7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacna2d4Q5RJF7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacna2d4Q5RJF7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacna2d4Q5RJF7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacna2d4Q5RJF7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacna2d4Q5RJF7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacna2d4Q5RJF7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacna2d4Q5RJF7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacna2d4Q5RJF7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacna2d4Q5RJF7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacna2d4Q5RJF7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacna2d4Q5RJF7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacna2d4Q5RJF7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacna2d4Q5RJF7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacna2d4Q5RJF7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacna2d4Q5RJF7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacna2d4Q5RJF7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacna2d4Q5RJF7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacna2d4Q5RJF7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacna2d4Q5RJF7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacna2d4Q5RJF7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacna2d4Q5RJF7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacna2d4Q5RJF7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cacna2d4Q5RJF7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cacna2d4Q5RJF7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cacna2d4Q5RJF7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cacna2d4Q5RJF7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cacna2d4Q5RJF7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cacna2d4Q5RJF7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cacna2d4Q5RJF7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cacna2d4Q5RJF7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cacna2d4Q5RJF7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cacna2d4Q5RJF7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cacna2d4Q5RJF7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cacna2d4Q5RJF7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cacna2d4Q5RJF7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacna2d4Q5RJF7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacna2d4Q5RJF7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cacna2d4Q5RJF7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cacna2d4Q5RJF7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cacna2d4Q5RJF7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cacna2d4Q5RJF7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cacna2d4Q5RJF7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cacna2d4Q5RJF7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cacna2d4Q5RJF7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacna2d4Q5RJF7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacna2d4Q5RJF7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacna2d4Q5RJF7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacna2d4Q5RJF7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacna2d4Q5RJF7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cacna2d4Q5RJF7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cacna2d4Q5RJF7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cacna2d4Q5RJF7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cacna2d4Q5RJF7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cacna2d4Q5RJF7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cacna2d4Q5RJF7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cacna2d4Q5RJF7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacna2d4Q5RJF7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacna2d4Q5RJF7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacna2d4Q5RJF7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacna2d4Q5RJF7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacna2d4Q5RJF7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacna2d4Q5RJF7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacna2d4Q5RJF7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacna2d4Q5RJF7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacna2d4Q5RJF7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacna2d4Q5RJF7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacna2d4Q5RJF7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacna2d4Q5RJF7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms