Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RilpQ5ND29 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RilpQ5ND29 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RilpQ5ND29 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RilpQ5ND29 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RilpQ5ND29 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RilpQ5ND29 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RilpQ5ND29 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RilpQ5ND29 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RilpQ5ND29 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RilpQ5ND29 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RilpQ5ND29 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RilpQ5ND29 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RilpQ5ND29 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RilpQ5ND29 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RilpQ5ND29 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RilpQ5ND29 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RilpQ5ND29 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RilpQ5ND29 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RilpQ5ND29 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RilpQ5ND29 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RilpQ5ND29 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RilpQ5ND29 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RilpQ5ND29 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RilpQ5ND29 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RilpQ5ND29 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RilpQ5ND29 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RilpQ5ND29 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RilpQ5ND29 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RilpQ5ND29 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RilpQ5ND29 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RilpQ5ND29 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RilpQ5ND29 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RilpQ5ND29 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RilpQ5ND29 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RilpQ5ND29 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RilpQ5ND29 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RilpQ5ND29 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RilpQ5ND29 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RilpQ5ND29 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RilpQ5ND29 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RilpQ5ND29 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RilpQ5ND29 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RilpQ5ND29 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RilpQ5ND29 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RilpQ5ND29 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RilpQ5ND29 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RilpQ5ND29 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RilpQ5ND29 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RilpQ5ND29 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RilpQ5ND29 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RilpQ5ND29 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RilpQ5ND29 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RilpQ5ND29 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RilpQ5ND29 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RilpQ5ND29 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RilpQ5ND29 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RilpQ5ND29 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RilpQ5ND29 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RilpQ5ND29 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RilpQ5ND29 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RilpQ5ND29 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RilpQ5ND29 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RilpQ5ND29 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RilpQ5ND29 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RilpQ5ND29 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RilpQ5ND29 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RilpQ5ND29 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RilpQ5ND29 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RilpQ5ND29 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RilpQ5ND29 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RilpQ5ND29 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RilpQ5ND29 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RilpQ5ND29 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RilpQ5ND29 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RilpQ5ND29 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RilpQ5ND29 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RilpQ5ND29 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RilpQ5ND29 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RilpQ5ND29 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RilpQ5ND29 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RilpQ5ND29 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RilpQ5ND29 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RilpQ5ND29 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RilpQ5ND29 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RilpQ5ND29 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RilpQ5ND29 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RilpQ5ND29 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RilpQ5ND29 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RilpQ5ND29 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RilpQ5ND29 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RilpQ5ND29 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RilpQ5ND29 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RilpQ5ND29 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RilpQ5ND29 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RilpQ5ND29 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RilpQ5ND29 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RilpQ5ND29 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RilpQ5ND29 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RilpQ5ND29 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms