Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCQ5

Dph1, 2-(3-amino-3-carboxypropyl)histidine synthase subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dph1Q5NCQ5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dph1Q5NCQ5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dph1Q5NCQ5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dph1Q5NCQ5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dph1Q5NCQ5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Dph1Q5NCQ5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dph1Q5NCQ5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dph1Q5NCQ5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dph1Q5NCQ5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dph1Q5NCQ5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Dph1Q5NCQ5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dph1Q5NCQ5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dph1Q5NCQ5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dph1Q5NCQ5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dph1Q5NCQ5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dph1Q5NCQ5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dph1Q5NCQ5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dph1Q5NCQ5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dph1Q5NCQ5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dph1Q5NCQ5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dph1Q5NCQ5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Dph1Q5NCQ5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dph1Q5NCQ5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dph1Q5NCQ5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dph1Q5NCQ5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dph1Q5NCQ5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dph1Q5NCQ5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dph1Q5NCQ5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dph1Q5NCQ5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dph1Q5NCQ5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Dph1Q5NCQ5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dph1Q5NCQ5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dph1Q5NCQ5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dph1Q5NCQ5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dph1Q5NCQ5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dph1Q5NCQ5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dph1Q5NCQ5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dph1Q5NCQ5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dph1Q5NCQ5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dph1Q5NCQ5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dph1Q5NCQ5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dph1Q5NCQ5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dph1Q5NCQ5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dph1Q5NCQ5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dph1Q5NCQ5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dph1Q5NCQ5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dph1Q5NCQ5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dph1Q5NCQ5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dph1Q5NCQ5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dph1Q5NCQ5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dph1Q5NCQ5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dph1Q5NCQ5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dph1Q5NCQ5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dph1Q5NCQ5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dph1Q5NCQ5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dph1Q5NCQ5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dph1Q5NCQ5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dph1Q5NCQ5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Dph1Q5NCQ5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dph1Q5NCQ5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dph1Q5NCQ5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dph1Q5NCQ5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dph1Q5NCQ5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dph1Q5NCQ5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dph1Q5NCQ5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Dph1Q5NCQ5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dph1Q5NCQ5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dph1Q5NCQ5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dph1Q5NCQ5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dph1Q5NCQ5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Dph1Q5NCQ5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dph1Q5NCQ5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dph1Q5NCQ5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dph1Q5NCQ5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dph1Q5NCQ5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dph1Q5NCQ5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dph1Q5NCQ5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dph1Q5NCQ5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dph1Q5NCQ5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dph1Q5NCQ5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dph1Q5NCQ5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dph1Q5NCQ5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dph1Q5NCQ5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dph1Q5NCQ5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dph1Q5NCQ5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dph1Q5NCQ5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dph1Q5NCQ5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dph1Q5NCQ5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dph1Q5NCQ5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dph1Q5NCQ5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dph1Q5NCQ5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dph1Q5NCQ5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dph1Q5NCQ5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dph1Q5NCQ5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dph1Q5NCQ5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dph1Q5NCQ5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dph1Q5NCQ5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dph1Q5NCQ5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dph1Q5NCQ5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dph1Q5NCQ5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms