Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCP0

Rnf43, E3 ubiquitin-protein ligase RNF43, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf43Q5NCP0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf43Q5NCP0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf43Q5NCP0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf43Q5NCP0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf43Q5NCP0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf43Q5NCP0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf43Q5NCP0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf43Q5NCP0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf43Q5NCP0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf43Q5NCP0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf43Q5NCP0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf43Q5NCP0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf43Q5NCP0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf43Q5NCP0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf43Q5NCP0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf43Q5NCP0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf43Q5NCP0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf43Q5NCP0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf43Q5NCP0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf43Q5NCP0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf43Q5NCP0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf43Q5NCP0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf43Q5NCP0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf43Q5NCP0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf43Q5NCP0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf43Q5NCP0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf43Q5NCP0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf43Q5NCP0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf43Q5NCP0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf43Q5NCP0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf43Q5NCP0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf43Q5NCP0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf43Q5NCP0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf43Q5NCP0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf43Q5NCP0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf43Q5NCP0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf43Q5NCP0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf43Q5NCP0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf43Q5NCP0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf43Q5NCP0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf43Q5NCP0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf43Q5NCP0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf43Q5NCP0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf43Q5NCP0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf43Q5NCP0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf43Q5NCP0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf43Q5NCP0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf43Q5NCP0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf43Q5NCP0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf43Q5NCP0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf43Q5NCP0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf43Q5NCP0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf43Q5NCP0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf43Q5NCP0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf43Q5NCP0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf43Q5NCP0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf43Q5NCP0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf43Q5NCP0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf43Q5NCP0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf43Q5NCP0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf43Q5NCP0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf43Q5NCP0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf43Q5NCP0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf43Q5NCP0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf43Q5NCP0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf43Q5NCP0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf43Q5NCP0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf43Q5NCP0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf43Q5NCP0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf43Q5NCP0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf43Q5NCP0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf43Q5NCP0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf43Q5NCP0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf43Q5NCP0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf43Q5NCP0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf43Q5NCP0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf43Q5NCP0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf43Q5NCP0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf43Q5NCP0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf43Q5NCP0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf43Q5NCP0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf43Q5NCP0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf43Q5NCP0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf43Q5NCP0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf43Q5NCP0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf43Q5NCP0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf43Q5NCP0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf43Q5NCP0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf43Q5NCP0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf43Q5NCP0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf43Q5NCP0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf43Q5NCP0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf43Q5NCP0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf43Q5NCP0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf43Q5NCP0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf43Q5NCP0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf43Q5NCP0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf43Q5NCP0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf43Q5NCP0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf43Q5NCP0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms