Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTU0

Afap1l2, Actin filament-associated protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afap1l2Q5DTU0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Afap1l2Q5DTU0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Afap1l2Q5DTU0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Afap1l2Q5DTU0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Afap1l2Q5DTU0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Afap1l2Q5DTU0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Afap1l2Q5DTU0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Afap1l2Q5DTU0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Afap1l2Q5DTU0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Afap1l2Q5DTU0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Afap1l2Q5DTU0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Afap1l2Q5DTU0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Afap1l2Q5DTU0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Afap1l2Q5DTU0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Afap1l2Q5DTU0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Afap1l2Q5DTU0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Afap1l2Q5DTU0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Afap1l2Q5DTU0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Afap1l2Q5DTU0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Afap1l2Q5DTU0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Afap1l2Q5DTU0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Afap1l2Q5DTU0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Afap1l2Q5DTU0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Afap1l2Q5DTU0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Afap1l2Q5DTU0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Afap1l2Q5DTU0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Afap1l2Q5DTU0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Afap1l2Q5DTU0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Afap1l2Q5DTU0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Afap1l2Q5DTU0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Afap1l2Q5DTU0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Afap1l2Q5DTU0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Afap1l2Q5DTU0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Afap1l2Q5DTU0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Afap1l2Q5DTU0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Afap1l2Q5DTU0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Afap1l2Q5DTU0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Afap1l2Q5DTU0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Afap1l2Q5DTU0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Afap1l2Q5DTU0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Afap1l2Q5DTU0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Afap1l2Q5DTU0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Afap1l2Q5DTU0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Afap1l2Q5DTU0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Afap1l2Q5DTU0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Afap1l2Q5DTU0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Afap1l2Q5DTU0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Afap1l2Q5DTU0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Afap1l2Q5DTU0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Afap1l2Q5DTU0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Afap1l2Q5DTU0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Afap1l2Q5DTU0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Afap1l2Q5DTU0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Afap1l2Q5DTU0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Afap1l2Q5DTU0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Afap1l2Q5DTU0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Afap1l2Q5DTU0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Afap1l2Q5DTU0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Afap1l2Q5DTU0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Afap1l2Q5DTU0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Afap1l2Q5DTU0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Afap1l2Q5DTU0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Afap1l2Q5DTU0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Afap1l2Q5DTU0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Afap1l2Q5DTU0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Afap1l2Q5DTU0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Afap1l2Q5DTU0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Afap1l2Q5DTU0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Afap1l2Q5DTU0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Afap1l2Q5DTU0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Afap1l2Q5DTU0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Afap1l2Q5DTU0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Afap1l2Q5DTU0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Afap1l2Q5DTU0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Afap1l2Q5DTU0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Afap1l2Q5DTU0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Afap1l2Q5DTU0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Afap1l2Q5DTU0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Afap1l2Q5DTU0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Afap1l2Q5DTU0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Afap1l2Q5DTU0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Afap1l2Q5DTU0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Afap1l2Q5DTU0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Afap1l2Q5DTU0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Afap1l2Q5DTU0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Afap1l2Q5DTU0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Afap1l2Q5DTU0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Afap1l2Q5DTU0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Afap1l2Q5DTU0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Afap1l2Q5DTU0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Afap1l2Q5DTU0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Afap1l2Q5DTU0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Afap1l2Q5DTU0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Afap1l2Q5DTU0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Afap1l2Q5DTU0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Afap1l2Q5DTU0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Afap1l2Q5DTU0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Afap1l2Q5DTU0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Afap1l2Q5DTU0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Afap1l2Q5DTU0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms