Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam208bQ5DTT3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam208bQ5DTT3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam208bQ5DTT3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam208bQ5DTT3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam208bQ5DTT3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam208bQ5DTT3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam208bQ5DTT3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam208bQ5DTT3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam208bQ5DTT3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam208bQ5DTT3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam208bQ5DTT3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam208bQ5DTT3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam208bQ5DTT3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam208bQ5DTT3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam208bQ5DTT3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam208bQ5DTT3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam208bQ5DTT3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam208bQ5DTT3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fam208bQ5DTT3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fam208bQ5DTT3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fam208bQ5DTT3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam208bQ5DTT3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam208bQ5DTT3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam208bQ5DTT3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam208bQ5DTT3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam208bQ5DTT3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam208bQ5DTT3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam208bQ5DTT3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam208bQ5DTT3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam208bQ5DTT3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Fam208bQ5DTT3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam208bQ5DTT3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam208bQ5DTT3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam208bQ5DTT3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam208bQ5DTT3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam208bQ5DTT3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam208bQ5DTT3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam208bQ5DTT3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam208bQ5DTT3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam208bQ5DTT3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam208bQ5DTT3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam208bQ5DTT3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam208bQ5DTT3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam208bQ5DTT3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam208bQ5DTT3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam208bQ5DTT3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam208bQ5DTT3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam208bQ5DTT3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam208bQ5DTT3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam208bQ5DTT3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam208bQ5DTT3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam208bQ5DTT3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam208bQ5DTT3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam208bQ5DTT3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam208bQ5DTT3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam208bQ5DTT3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam208bQ5DTT3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam208bQ5DTT3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam208bQ5DTT3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam208bQ5DTT3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam208bQ5DTT3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam208bQ5DTT3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam208bQ5DTT3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam208bQ5DTT3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam208bQ5DTT3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam208bQ5DTT3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam208bQ5DTT3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam208bQ5DTT3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam208bQ5DTT3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam208bQ5DTT3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam208bQ5DTT3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam208bQ5DTT3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam208bQ5DTT3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fam208bQ5DTT3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam208bQ5DTT3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam208bQ5DTT3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam208bQ5DTT3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam208bQ5DTT3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam208bQ5DTT3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam208bQ5DTT3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam208bQ5DTT3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam208bQ5DTT3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam208bQ5DTT3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam208bQ5DTT3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam208bQ5DTT3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam208bQ5DTT3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam208bQ5DTT3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam208bQ5DTT3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam208bQ5DTT3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam208bQ5DTT3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam208bQ5DTT3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms