Protein–RNA interactions for Protein: Q56A06

Tmtc2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc2Q56A06 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmtc2Q56A06 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmtc2Q56A06 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmtc2Q56A06 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmtc2Q56A06 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tmtc2Q56A06 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tmtc2Q56A06 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tmtc2Q56A06 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tmtc2Q56A06 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmtc2Q56A06 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmtc2Q56A06 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmtc2Q56A06 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmtc2Q56A06 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmtc2Q56A06 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmtc2Q56A06 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmtc2Q56A06 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmtc2Q56A06 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmtc2Q56A06 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmtc2Q56A06 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmtc2Q56A06 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmtc2Q56A06 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmtc2Q56A06 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmtc2Q56A06 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmtc2Q56A06 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmtc2Q56A06 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmtc2Q56A06 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmtc2Q56A06 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmtc2Q56A06 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmtc2Q56A06 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmtc2Q56A06 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmtc2Q56A06 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmtc2Q56A06 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmtc2Q56A06 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmtc2Q56A06 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmtc2Q56A06 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmtc2Q56A06 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmtc2Q56A06 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmtc2Q56A06 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmtc2Q56A06 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmtc2Q56A06 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmtc2Q56A06 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmtc2Q56A06 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmtc2Q56A06 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmtc2Q56A06 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmtc2Q56A06 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmtc2Q56A06 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmtc2Q56A06 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmtc2Q56A06 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmtc2Q56A06 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmtc2Q56A06 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmtc2Q56A06 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmtc2Q56A06 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmtc2Q56A06 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmtc2Q56A06 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmtc2Q56A06 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmtc2Q56A06 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmtc2Q56A06 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmtc2Q56A06 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmtc2Q56A06 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmtc2Q56A06 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmtc2Q56A06 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmtc2Q56A06 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmtc2Q56A06 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmtc2Q56A06 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmtc2Q56A06 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmtc2Q56A06 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmtc2Q56A06 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmtc2Q56A06 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmtc2Q56A06 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmtc2Q56A06 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmtc2Q56A06 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmtc2Q56A06 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmtc2Q56A06 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmtc2Q56A06 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmtc2Q56A06 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmtc2Q56A06 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmtc2Q56A06 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmtc2Q56A06 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmtc2Q56A06 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmtc2Q56A06 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmtc2Q56A06 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmtc2Q56A06 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmtc2Q56A06 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmtc2Q56A06 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmtc2Q56A06 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmtc2Q56A06 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmtc2Q56A06 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmtc2Q56A06 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmtc2Q56A06 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmtc2Q56A06 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmtc2Q56A06 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmtc2Q56A06 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmtc2Q56A06 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmtc2Q56A06 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tmtc2Q56A06 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmtc2Q56A06 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmtc2Q56A06 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmtc2Q56A06 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmtc2Q56A06 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmtc2Q56A06 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms