Protein–RNA interactions for Protein: Q52KH6

Gm14685, DNA segment, Chr X, Baylor 18, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm14685Q52KH6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm14685Q52KH6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm14685Q52KH6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm14685Q52KH6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm14685Q52KH6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm14685Q52KH6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm14685Q52KH6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm14685Q52KH6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm14685Q52KH6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm14685Q52KH6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm14685Q52KH6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm14685Q52KH6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm14685Q52KH6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm14685Q52KH6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm14685Q52KH6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm14685Q52KH6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm14685Q52KH6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm14685Q52KH6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm14685Q52KH6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm14685Q52KH6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm14685Q52KH6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm14685Q52KH6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm14685Q52KH6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm14685Q52KH6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm14685Q52KH6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm14685Q52KH6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm14685Q52KH6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm14685Q52KH6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm14685Q52KH6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm14685Q52KH6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm14685Q52KH6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm14685Q52KH6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm14685Q52KH6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm14685Q52KH6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm14685Q52KH6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm14685Q52KH6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm14685Q52KH6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm14685Q52KH6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm14685Q52KH6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm14685Q52KH6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm14685Q52KH6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm14685Q52KH6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm14685Q52KH6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm14685Q52KH6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm14685Q52KH6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm14685Q52KH6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm14685Q52KH6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm14685Q52KH6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm14685Q52KH6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm14685Q52KH6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm14685Q52KH6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm14685Q52KH6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm14685Q52KH6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm14685Q52KH6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm14685Q52KH6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm14685Q52KH6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm14685Q52KH6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm14685Q52KH6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm14685Q52KH6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm14685Q52KH6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm14685Q52KH6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm14685Q52KH6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm14685Q52KH6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm14685Q52KH6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm14685Q52KH6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm14685Q52KH6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm14685Q52KH6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm14685Q52KH6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm14685Q52KH6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm14685Q52KH6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm14685Q52KH6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm14685Q52KH6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm14685Q52KH6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm14685Q52KH6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm14685Q52KH6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm14685Q52KH6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm14685Q52KH6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm14685Q52KH6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm14685Q52KH6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm14685Q52KH6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm14685Q52KH6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm14685Q52KH6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm14685Q52KH6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm14685Q52KH6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm14685Q52KH6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm14685Q52KH6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm14685Q52KH6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm14685Q52KH6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm14685Q52KH6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm14685Q52KH6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm14685Q52KH6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm14685Q52KH6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm14685Q52KH6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm14685Q52KH6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm14685Q52KH6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm14685Q52KH6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm14685Q52KH6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm14685Q52KH6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm14685Q52KH6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm14685Q52KH6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms