Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc47Q505F5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc47Q505F5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc47Q505F5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc47Q505F5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc47Q505F5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc47Q505F5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc47Q505F5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc47Q505F5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc47Q505F5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc47Q505F5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc47Q505F5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc47Q505F5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc47Q505F5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc47Q505F5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc47Q505F5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc47Q505F5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc47Q505F5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc47Q505F5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc47Q505F5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc47Q505F5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc47Q505F5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc47Q505F5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc47Q505F5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc47Q505F5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc47Q505F5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc47Q505F5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc47Q505F5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc47Q505F5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc47Q505F5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc47Q505F5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc47Q505F5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc47Q505F5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc47Q505F5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc47Q505F5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc47Q505F5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc47Q505F5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc47Q505F5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc47Q505F5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc47Q505F5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc47Q505F5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc47Q505F5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc47Q505F5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc47Q505F5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc47Q505F5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc47Q505F5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc47Q505F5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc47Q505F5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc47Q505F5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc47Q505F5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc47Q505F5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc47Q505F5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc47Q505F5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc47Q505F5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc47Q505F5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc47Q505F5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc47Q505F5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc47Q505F5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc47Q505F5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc47Q505F5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc47Q505F5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc47Q505F5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc47Q505F5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc47Q505F5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrrc47Q505F5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrrc47Q505F5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrrc47Q505F5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrrc47Q505F5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc47Q505F5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc47Q505F5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc47Q505F5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc47Q505F5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc47Q505F5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc47Q505F5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc47Q505F5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc47Q505F5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc47Q505F5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc47Q505F5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc47Q505F5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc47Q505F5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc47Q505F5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc47Q505F5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc47Q505F5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc47Q505F5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc47Q505F5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc47Q505F5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc47Q505F5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc47Q505F5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc47Q505F5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc47Q505F5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc47Q505F5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc47Q505F5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc47Q505F5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc47Q505F5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc47Q505F5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc47Q505F5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc47Q505F5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc47Q505F5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc47Q505F5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc47Q505F5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms