Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5935Q497S0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm5935Q497S0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm5935Q497S0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm5935Q497S0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm5935Q497S0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm5935Q497S0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm5935Q497S0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm5935Q497S0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm5935Q497S0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm5935Q497S0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm5935Q497S0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm5935Q497S0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm5935Q497S0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm5935Q497S0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm5935Q497S0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm5935Q497S0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm5935Q497S0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm5935Q497S0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm5935Q497S0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm5935Q497S0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm5935Q497S0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm5935Q497S0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm5935Q497S0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm5935Q497S0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm5935Q497S0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm5935Q497S0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm5935Q497S0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm5935Q497S0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm5935Q497S0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm5935Q497S0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm5935Q497S0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm5935Q497S0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm5935Q497S0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm5935Q497S0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm5935Q497S0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm5935Q497S0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm5935Q497S0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm5935Q497S0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm5935Q497S0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm5935Q497S0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm5935Q497S0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm5935Q497S0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm5935Q497S0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm5935Q497S0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm5935Q497S0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm5935Q497S0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5935Q497S0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5935Q497S0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5935Q497S0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5935Q497S0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5935Q497S0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5935Q497S0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5935Q497S0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5935Q497S0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5935Q497S0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5935Q497S0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5935Q497S0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5935Q497S0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5935Q497S0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5935Q497S0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5935Q497S0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5935Q497S0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5935Q497S0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm5935Q497S0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm5935Q497S0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm5935Q497S0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm5935Q497S0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm5935Q497S0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm5935Q497S0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm5935Q497S0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm5935Q497S0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm5935Q497S0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm5935Q497S0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm5935Q497S0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm5935Q497S0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm5935Q497S0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm5935Q497S0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm5935Q497S0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm5935Q497S0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm5935Q497S0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm5935Q497S0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm5935Q497S0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm5935Q497S0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm5935Q497S0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm5935Q497S0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm5935Q497S0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm5935Q497S0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm5935Q497S0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm5935Q497S0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm5935Q497S0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm5935Q497S0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm5935Q497S0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm5935Q497S0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm5935Q497S0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm5935Q497S0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm5935Q497S0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm5935Q497S0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5935Q497S0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5935Q497S0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5935Q497S0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.8 ms