Protein–RNA interactions for Protein: Q3V053

4933427I04Rik, Riken cDNA 4933427I04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933427I04RikQ3V053 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4933427I04RikQ3V053 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4933427I04RikQ3V053 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
4933427I04RikQ3V053 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
4933427I04RikQ3V053 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4933427I04RikQ3V053 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4933427I04RikQ3V053 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4933427I04RikQ3V053 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4933427I04RikQ3V053 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4933427I04RikQ3V053 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
4933427I04RikQ3V053 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
4933427I04RikQ3V053 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
4933427I04RikQ3V053 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
4933427I04RikQ3V053 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
4933427I04RikQ3V053 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
4933427I04RikQ3V053 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
4933427I04RikQ3V053 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
4933427I04RikQ3V053 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
4933427I04RikQ3V053 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4933427I04RikQ3V053 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4933427I04RikQ3V053 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4933427I04RikQ3V053 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
4933427I04RikQ3V053 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4933427I04RikQ3V053 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4933427I04RikQ3V053 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4933427I04RikQ3V053 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
4933427I04RikQ3V053 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
4933427I04RikQ3V053 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4933427I04RikQ3V053 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
4933427I04RikQ3V053 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
4933427I04RikQ3V053 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
4933427I04RikQ3V053 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
4933427I04RikQ3V053 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
4933427I04RikQ3V053 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
4933427I04RikQ3V053 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
4933427I04RikQ3V053 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
4933427I04RikQ3V053 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4933427I04RikQ3V053 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4933427I04RikQ3V053 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4933427I04RikQ3V053 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4933427I04RikQ3V053 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4933427I04RikQ3V053 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
4933427I04RikQ3V053 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4933427I04RikQ3V053 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4933427I04RikQ3V053 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
4933427I04RikQ3V053 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4933427I04RikQ3V053 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
4933427I04RikQ3V053 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4933427I04RikQ3V053 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4933427I04RikQ3V053 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4933427I04RikQ3V053 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
4933427I04RikQ3V053 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
4933427I04RikQ3V053 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4933427I04RikQ3V053 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4933427I04RikQ3V053 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4933427I04RikQ3V053 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
4933427I04RikQ3V053 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
4933427I04RikQ3V053 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4933427I04RikQ3V053 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4933427I04RikQ3V053 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4933427I04RikQ3V053 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4933427I04RikQ3V053 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
4933427I04RikQ3V053 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
4933427I04RikQ3V053 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4933427I04RikQ3V053 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4933427I04RikQ3V053 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4933427I04RikQ3V053 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4933427I04RikQ3V053 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4933427I04RikQ3V053 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4933427I04RikQ3V053 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4933427I04RikQ3V053 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
4933427I04RikQ3V053 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4933427I04RikQ3V053 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4933427I04RikQ3V053 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
4933427I04RikQ3V053 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
4933427I04RikQ3V053 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
4933427I04RikQ3V053 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
4933427I04RikQ3V053 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
4933427I04RikQ3V053 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
4933427I04RikQ3V053 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
4933427I04RikQ3V053 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4933427I04RikQ3V053 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4933427I04RikQ3V053 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4933427I04RikQ3V053 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4933427I04RikQ3V053 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4933427I04RikQ3V053 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4933427I04RikQ3V053 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
4933427I04RikQ3V053 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4933427I04RikQ3V053 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
4933427I04RikQ3V053 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4933427I04RikQ3V053 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
4933427I04RikQ3V053 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
4933427I04RikQ3V053 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
4933427I04RikQ3V053 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
4933427I04RikQ3V053 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4933427I04RikQ3V053 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
4933427I04RikQ3V053 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4933427I04RikQ3V053 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4933427I04RikQ3V053 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4933427I04RikQ3V053 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms