Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW50

Gm27235, Predicted gene 27235, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27235Q3UW50 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm27235Q3UW50 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm27235Q3UW50 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm27235Q3UW50 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm27235Q3UW50 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm27235Q3UW50 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm27235Q3UW50 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm27235Q3UW50 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm27235Q3UW50 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm27235Q3UW50 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm27235Q3UW50 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm27235Q3UW50 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm27235Q3UW50 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm27235Q3UW50 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm27235Q3UW50 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm27235Q3UW50 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm27235Q3UW50 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm27235Q3UW50 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm27235Q3UW50 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm27235Q3UW50 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm27235Q3UW50 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm27235Q3UW50 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm27235Q3UW50 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm27235Q3UW50 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm27235Q3UW50 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm27235Q3UW50 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm27235Q3UW50 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm27235Q3UW50 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm27235Q3UW50 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm27235Q3UW50 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm27235Q3UW50 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm27235Q3UW50 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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