Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr1d1Q3UV55 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr1d1Q3UV55 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr1d1Q3UV55 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr1d1Q3UV55 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr1d1Q3UV55 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr1d1Q3UV55 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr1d1Q3UV55 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr1d1Q3UV55 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr1d1Q3UV55 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr1d1Q3UV55 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr1d1Q3UV55 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr1d1Q3UV55 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr1d1Q3UV55 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nr1d1Q3UV55 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nr1d1Q3UV55 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr1d1Q3UV55 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr1d1Q3UV55 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr1d1Q3UV55 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr1d1Q3UV55 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr1d1Q3UV55 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr1d1Q3UV55 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr1d1Q3UV55 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr1d1Q3UV55 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr1d1Q3UV55 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr1d1Q3UV55 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr1d1Q3UV55 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr1d1Q3UV55 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr1d1Q3UV55 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr1d1Q3UV55 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr1d1Q3UV55 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr1d1Q3UV55 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr1d1Q3UV55 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr1d1Q3UV55 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr1d1Q3UV55 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr1d1Q3UV55 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr1d1Q3UV55 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr1d1Q3UV55 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr1d1Q3UV55 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr1d1Q3UV55 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr1d1Q3UV55 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr1d1Q3UV55 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr1d1Q3UV55 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr1d1Q3UV55 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr1d1Q3UV55 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr1d1Q3UV55 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nr1d1Q3UV55 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nr1d1Q3UV55 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nr1d1Q3UV55 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nr1d1Q3UV55 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nr1d1Q3UV55 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nr1d1Q3UV55 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nr1d1Q3UV55 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nr1d1Q3UV55 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nr1d1Q3UV55 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nr1d1Q3UV55 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nr1d1Q3UV55 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nr1d1Q3UV55 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nr1d1Q3UV55 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nr1d1Q3UV55 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nr1d1Q3UV55 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nr1d1Q3UV55 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nr1d1Q3UV55 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr1d1Q3UV55 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr1d1Q3UV55 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr1d1Q3UV55 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr1d1Q3UV55 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr1d1Q3UV55 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr1d1Q3UV55 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr1d1Q3UV55 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr1d1Q3UV55 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr1d1Q3UV55 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr1d1Q3UV55 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr1d1Q3UV55 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr1d1Q3UV55 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr1d1Q3UV55 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr1d1Q3UV55 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr1d1Q3UV55 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr1d1Q3UV55 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr1d1Q3UV55 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr1d1Q3UV55 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr1d1Q3UV55 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr1d1Q3UV55 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nr1d1Q3UV55 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nr1d1Q3UV55 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nr1d1Q3UV55 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr1d1Q3UV55 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr1d1Q3UV55 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr1d1Q3UV55 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr1d1Q3UV55 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr1d1Q3UV55 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr1d1Q3UV55 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr1d1Q3UV55 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr1d1Q3UV55 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nr1d1Q3UV55 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nr1d1Q3UV55 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nr1d1Q3UV55 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nr1d1Q3UV55 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nr1d1Q3UV55 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nr1d1Q3UV55 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.1 ms