Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUY6

Prom2, Prominin-2, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom2Q3UUY6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Prom2Q3UUY6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prom2Q3UUY6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prom2Q3UUY6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Prom2Q3UUY6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Prom2Q3UUY6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Prom2Q3UUY6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Prom2Q3UUY6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Prom2Q3UUY6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Prom2Q3UUY6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Prom2Q3UUY6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Prom2Q3UUY6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prom2Q3UUY6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Prom2Q3UUY6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prom2Q3UUY6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prom2Q3UUY6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prom2Q3UUY6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prom2Q3UUY6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Prom2Q3UUY6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prom2Q3UUY6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prom2Q3UUY6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prom2Q3UUY6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prom2Q3UUY6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prom2Q3UUY6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prom2Q3UUY6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prom2Q3UUY6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prom2Q3UUY6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prom2Q3UUY6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prom2Q3UUY6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Prom2Q3UUY6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prom2Q3UUY6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prom2Q3UUY6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Prom2Q3UUY6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prom2Q3UUY6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prom2Q3UUY6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prom2Q3UUY6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prom2Q3UUY6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prom2Q3UUY6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prom2Q3UUY6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prom2Q3UUY6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prom2Q3UUY6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prom2Q3UUY6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prom2Q3UUY6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prom2Q3UUY6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prom2Q3UUY6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prom2Q3UUY6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prom2Q3UUY6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prom2Q3UUY6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prom2Q3UUY6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Prom2Q3UUY6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prom2Q3UUY6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Prom2Q3UUY6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prom2Q3UUY6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prom2Q3UUY6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prom2Q3UUY6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Prom2Q3UUY6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prom2Q3UUY6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prom2Q3UUY6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prom2Q3UUY6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Prom2Q3UUY6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prom2Q3UUY6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prom2Q3UUY6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prom2Q3UUY6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prom2Q3UUY6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prom2Q3UUY6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prom2Q3UUY6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prom2Q3UUY6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prom2Q3UUY6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prom2Q3UUY6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prom2Q3UUY6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prom2Q3UUY6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prom2Q3UUY6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prom2Q3UUY6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prom2Q3UUY6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prom2Q3UUY6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prom2Q3UUY6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prom2Q3UUY6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prom2Q3UUY6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prom2Q3UUY6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prom2Q3UUY6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prom2Q3UUY6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prom2Q3UUY6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prom2Q3UUY6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prom2Q3UUY6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prom2Q3UUY6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prom2Q3UUY6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prom2Q3UUY6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prom2Q3UUY6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prom2Q3UUY6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prom2Q3UUY6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prom2Q3UUY6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prom2Q3UUY6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prom2Q3UUY6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prom2Q3UUY6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prom2Q3UUY6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prom2Q3UUY6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prom2Q3UUY6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prom2Q3UUY6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prom2Q3UUY6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prom2Q3UUY6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms