Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Chpf2Q3UU43 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Chpf2Q3UU43 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Chpf2Q3UU43 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Chpf2Q3UU43 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Chpf2Q3UU43 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Chpf2Q3UU43 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Chpf2Q3UU43 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Chpf2Q3UU43 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Chpf2Q3UU43 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Chpf2Q3UU43 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Chpf2Q3UU43 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Chpf2Q3UU43 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Chpf2Q3UU43 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Chpf2Q3UU43 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chpf2Q3UU43 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chpf2Q3UU43 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chpf2Q3UU43 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chpf2Q3UU43 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chpf2Q3UU43 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chpf2Q3UU43 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chpf2Q3UU43 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chpf2Q3UU43 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chpf2Q3UU43 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chpf2Q3UU43 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Chpf2Q3UU43 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Chpf2Q3UU43 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Chpf2Q3UU43 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Chpf2Q3UU43 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Chpf2Q3UU43 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Chpf2Q3UU43 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Chpf2Q3UU43 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Chpf2Q3UU43 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Chpf2Q3UU43 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Chpf2Q3UU43 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Chpf2Q3UU43 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Chpf2Q3UU43 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Chpf2Q3UU43 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Chpf2Q3UU43 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Chpf2Q3UU43 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Chpf2Q3UU43 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Chpf2Q3UU43 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Chpf2Q3UU43 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Chpf2Q3UU43 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Chpf2Q3UU43 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Chpf2Q3UU43 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Chpf2Q3UU43 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Chpf2Q3UU43 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Chpf2Q3UU43 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Chpf2Q3UU43 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Chpf2Q3UU43 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Chpf2Q3UU43 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chpf2Q3UU43 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chpf2Q3UU43 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chpf2Q3UU43 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chpf2Q3UU43 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chpf2Q3UU43 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chpf2Q3UU43 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Chpf2Q3UU43 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Chpf2Q3UU43 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Chpf2Q3UU43 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chpf2Q3UU43 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chpf2Q3UU43 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Chpf2Q3UU43 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chpf2Q3UU43 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Chpf2Q3UU43 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Chpf2Q3UU43 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chpf2Q3UU43 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chpf2Q3UU43 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chpf2Q3UU43 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chpf2Q3UU43 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Chpf2Q3UU43 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Chpf2Q3UU43 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Chpf2Q3UU43 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Chpf2Q3UU43 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Chpf2Q3UU43 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Chpf2Q3UU43 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Chpf2Q3UU43 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Chpf2Q3UU43 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Chpf2Q3UU43 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Chpf2Q3UU43 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Chpf2Q3UU43 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chpf2Q3UU43 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chpf2Q3UU43 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chpf2Q3UU43 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Chpf2Q3UU43 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chpf2Q3UU43 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chpf2Q3UU43 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chpf2Q3UU43 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chpf2Q3UU43 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chpf2Q3UU43 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chpf2Q3UU43 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chpf2Q3UU43 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chpf2Q3UU43 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chpf2Q3UU43 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chpf2Q3UU43 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chpf2Q3UU43 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chpf2Q3UU43 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chpf2Q3UU43 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Chpf2Q3UU43 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms