Protein–RNA interactions for Protein: Q3USZ2

Ubtfl1, Upstream-binding factor 1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubtfl1Q3USZ2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubtfl1Q3USZ2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubtfl1Q3USZ2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubtfl1Q3USZ2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubtfl1Q3USZ2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubtfl1Q3USZ2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubtfl1Q3USZ2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubtfl1Q3USZ2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubtfl1Q3USZ2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubtfl1Q3USZ2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubtfl1Q3USZ2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubtfl1Q3USZ2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubtfl1Q3USZ2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubtfl1Q3USZ2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubtfl1Q3USZ2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubtfl1Q3USZ2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubtfl1Q3USZ2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubtfl1Q3USZ2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubtfl1Q3USZ2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubtfl1Q3USZ2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubtfl1Q3USZ2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubtfl1Q3USZ2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubtfl1Q3USZ2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubtfl1Q3USZ2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubtfl1Q3USZ2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubtfl1Q3USZ2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubtfl1Q3USZ2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubtfl1Q3USZ2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubtfl1Q3USZ2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubtfl1Q3USZ2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubtfl1Q3USZ2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubtfl1Q3USZ2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubtfl1Q3USZ2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubtfl1Q3USZ2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubtfl1Q3USZ2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubtfl1Q3USZ2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubtfl1Q3USZ2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubtfl1Q3USZ2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubtfl1Q3USZ2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubtfl1Q3USZ2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubtfl1Q3USZ2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubtfl1Q3USZ2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubtfl1Q3USZ2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubtfl1Q3USZ2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubtfl1Q3USZ2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubtfl1Q3USZ2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubtfl1Q3USZ2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubtfl1Q3USZ2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubtfl1Q3USZ2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubtfl1Q3USZ2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubtfl1Q3USZ2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubtfl1Q3USZ2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubtfl1Q3USZ2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ubtfl1Q3USZ2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ubtfl1Q3USZ2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ubtfl1Q3USZ2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubtfl1Q3USZ2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubtfl1Q3USZ2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubtfl1Q3USZ2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubtfl1Q3USZ2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubtfl1Q3USZ2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubtfl1Q3USZ2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubtfl1Q3USZ2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubtfl1Q3USZ2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubtfl1Q3USZ2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubtfl1Q3USZ2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubtfl1Q3USZ2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubtfl1Q3USZ2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubtfl1Q3USZ2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubtfl1Q3USZ2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubtfl1Q3USZ2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubtfl1Q3USZ2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubtfl1Q3USZ2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubtfl1Q3USZ2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubtfl1Q3USZ2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubtfl1Q3USZ2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubtfl1Q3USZ2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubtfl1Q3USZ2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubtfl1Q3USZ2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubtfl1Q3USZ2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubtfl1Q3USZ2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubtfl1Q3USZ2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubtfl1Q3USZ2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubtfl1Q3USZ2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubtfl1Q3USZ2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubtfl1Q3USZ2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubtfl1Q3USZ2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubtfl1Q3USZ2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubtfl1Q3USZ2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubtfl1Q3USZ2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubtfl1Q3USZ2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubtfl1Q3USZ2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubtfl1Q3USZ2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubtfl1Q3USZ2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubtfl1Q3USZ2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubtfl1Q3USZ2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubtfl1Q3USZ2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubtfl1Q3USZ2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ubtfl1Q3USZ2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ubtfl1Q3USZ2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
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