Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TceancQ3US16 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TceancQ3US16 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TceancQ3US16 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TceancQ3US16 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TceancQ3US16 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TceancQ3US16 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TceancQ3US16 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TceancQ3US16 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TceancQ3US16 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TceancQ3US16 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TceancQ3US16 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TceancQ3US16 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TceancQ3US16 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TceancQ3US16 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TceancQ3US16 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TceancQ3US16 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TceancQ3US16 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TceancQ3US16 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TceancQ3US16 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TceancQ3US16 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TceancQ3US16 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TceancQ3US16 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TceancQ3US16 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TceancQ3US16 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TceancQ3US16 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TceancQ3US16 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TceancQ3US16 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TceancQ3US16 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TceancQ3US16 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TceancQ3US16 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TceancQ3US16 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TceancQ3US16 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TceancQ3US16 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TceancQ3US16 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TceancQ3US16 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TceancQ3US16 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TceancQ3US16 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TceancQ3US16 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TceancQ3US16 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TceancQ3US16 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TceancQ3US16 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TceancQ3US16 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TceancQ3US16 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TceancQ3US16 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TceancQ3US16 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TceancQ3US16 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TceancQ3US16 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TceancQ3US16 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TceancQ3US16 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TceancQ3US16 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TceancQ3US16 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TceancQ3US16 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TceancQ3US16 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TceancQ3US16 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TceancQ3US16 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TceancQ3US16 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TceancQ3US16 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TceancQ3US16 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TceancQ3US16 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TceancQ3US16 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TceancQ3US16 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TceancQ3US16 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TceancQ3US16 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TceancQ3US16 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TceancQ3US16 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TceancQ3US16 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TceancQ3US16 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TceancQ3US16 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TceancQ3US16 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TceancQ3US16 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TceancQ3US16 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TceancQ3US16 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TceancQ3US16 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TceancQ3US16 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TceancQ3US16 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TceancQ3US16 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TceancQ3US16 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TceancQ3US16 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TceancQ3US16 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TceancQ3US16 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TceancQ3US16 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TceancQ3US16 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TceancQ3US16 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TceancQ3US16 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TceancQ3US16 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TceancQ3US16 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TceancQ3US16 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TceancQ3US16 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TceancQ3US16 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TceancQ3US16 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TceancQ3US16 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TceancQ3US16 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TceancQ3US16 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TceancQ3US16 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TceancQ3US16 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TceancQ3US16 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TceancQ3US16 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TceancQ3US16 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TceancQ3US16 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms