Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQS8

Rbm20, RNA-binding protein 20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm20Q3UQS8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbm20Q3UQS8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbm20Q3UQS8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbm20Q3UQS8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbm20Q3UQS8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbm20Q3UQS8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbm20Q3UQS8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbm20Q3UQS8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbm20Q3UQS8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbm20Q3UQS8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rbm20Q3UQS8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rbm20Q3UQS8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rbm20Q3UQS8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rbm20Q3UQS8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rbm20Q3UQS8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rbm20Q3UQS8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rbm20Q3UQS8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rbm20Q3UQS8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbm20Q3UQS8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbm20Q3UQS8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbm20Q3UQS8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbm20Q3UQS8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbm20Q3UQS8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbm20Q3UQS8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbm20Q3UQS8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rbm20Q3UQS8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rbm20Q3UQS8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rbm20Q3UQS8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rbm20Q3UQS8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rbm20Q3UQS8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rbm20Q3UQS8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbm20Q3UQS8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbm20Q3UQS8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbm20Q3UQS8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbm20Q3UQS8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbm20Q3UQS8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbm20Q3UQS8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbm20Q3UQS8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbm20Q3UQS8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbm20Q3UQS8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbm20Q3UQS8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbm20Q3UQS8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rbm20Q3UQS8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rbm20Q3UQS8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rbm20Q3UQS8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rbm20Q3UQS8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rbm20Q3UQS8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rbm20Q3UQS8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rbm20Q3UQS8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rbm20Q3UQS8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rbm20Q3UQS8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rbm20Q3UQS8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rbm20Q3UQS8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rbm20Q3UQS8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rbm20Q3UQS8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbm20Q3UQS8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbm20Q3UQS8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbm20Q3UQS8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbm20Q3UQS8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbm20Q3UQS8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbm20Q3UQS8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbm20Q3UQS8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbm20Q3UQS8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbm20Q3UQS8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbm20Q3UQS8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbm20Q3UQS8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbm20Q3UQS8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbm20Q3UQS8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbm20Q3UQS8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbm20Q3UQS8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbm20Q3UQS8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbm20Q3UQS8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbm20Q3UQS8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Rbm20Q3UQS8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbm20Q3UQS8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbm20Q3UQS8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbm20Q3UQS8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbm20Q3UQS8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbm20Q3UQS8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbm20Q3UQS8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbm20Q3UQS8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbm20Q3UQS8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbm20Q3UQS8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbm20Q3UQS8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbm20Q3UQS8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbm20Q3UQS8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbm20Q3UQS8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbm20Q3UQS8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbm20Q3UQS8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbm20Q3UQS8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbm20Q3UQS8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbm20Q3UQS8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbm20Q3UQS8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbm20Q3UQS8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbm20Q3UQS8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbm20Q3UQS8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbm20Q3UQS8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbm20Q3UQS8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbm20Q3UQS8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rbm20Q3UQS8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
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