Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPW2

Elf3, ETS-related transcription factor Elf-3, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elf3Q3UPW2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Elf3Q3UPW2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Elf3Q3UPW2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Elf3Q3UPW2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Elf3Q3UPW2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Elf3Q3UPW2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Elf3Q3UPW2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Elf3Q3UPW2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Elf3Q3UPW2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Elf3Q3UPW2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Elf3Q3UPW2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Elf3Q3UPW2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Elf3Q3UPW2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Elf3Q3UPW2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Elf3Q3UPW2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Elf3Q3UPW2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Elf3Q3UPW2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Elf3Q3UPW2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Elf3Q3UPW2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Elf3Q3UPW2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Elf3Q3UPW2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Elf3Q3UPW2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Elf3Q3UPW2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Elf3Q3UPW2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Elf3Q3UPW2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Elf3Q3UPW2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Elf3Q3UPW2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Elf3Q3UPW2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Elf3Q3UPW2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Elf3Q3UPW2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Elf3Q3UPW2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Elf3Q3UPW2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Elf3Q3UPW2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Elf3Q3UPW2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Elf3Q3UPW2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Elf3Q3UPW2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Elf3Q3UPW2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Elf3Q3UPW2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Elf3Q3UPW2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Elf3Q3UPW2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Elf3Q3UPW2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Elf3Q3UPW2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Elf3Q3UPW2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Elf3Q3UPW2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Elf3Q3UPW2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Elf3Q3UPW2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Elf3Q3UPW2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Elf3Q3UPW2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Elf3Q3UPW2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Elf3Q3UPW2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Elf3Q3UPW2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Elf3Q3UPW2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Elf3Q3UPW2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Elf3Q3UPW2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Elf3Q3UPW2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Elf3Q3UPW2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Elf3Q3UPW2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Elf3Q3UPW2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Elf3Q3UPW2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Elf3Q3UPW2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Elf3Q3UPW2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Elf3Q3UPW2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Elf3Q3UPW2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Elf3Q3UPW2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Elf3Q3UPW2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Elf3Q3UPW2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Elf3Q3UPW2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Elf3Q3UPW2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Elf3Q3UPW2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Elf3Q3UPW2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Elf3Q3UPW2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Elf3Q3UPW2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Elf3Q3UPW2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Elf3Q3UPW2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Elf3Q3UPW2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Elf3Q3UPW2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Elf3Q3UPW2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Elf3Q3UPW2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Elf3Q3UPW2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Elf3Q3UPW2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Elf3Q3UPW2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Elf3Q3UPW2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Elf3Q3UPW2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Elf3Q3UPW2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Elf3Q3UPW2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Elf3Q3UPW2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Elf3Q3UPW2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Elf3Q3UPW2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Elf3Q3UPW2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Elf3Q3UPW2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Elf3Q3UPW2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Elf3Q3UPW2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Elf3Q3UPW2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Elf3Q3UPW2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Elf3Q3UPW2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Elf3Q3UPW2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Elf3Q3UPW2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Elf3Q3UPW2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Elf3Q3UPW2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Elf3Q3UPW2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms