Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cln5Q3UMW8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cln5Q3UMW8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cln5Q3UMW8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cln5Q3UMW8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cln5Q3UMW8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cln5Q3UMW8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cln5Q3UMW8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cln5Q3UMW8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cln5Q3UMW8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cln5Q3UMW8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cln5Q3UMW8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cln5Q3UMW8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cln5Q3UMW8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cln5Q3UMW8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cln5Q3UMW8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cln5Q3UMW8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cln5Q3UMW8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cln5Q3UMW8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cln5Q3UMW8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cln5Q3UMW8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cln5Q3UMW8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cln5Q3UMW8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cln5Q3UMW8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cln5Q3UMW8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cln5Q3UMW8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cln5Q3UMW8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cln5Q3UMW8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cln5Q3UMW8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cln5Q3UMW8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cln5Q3UMW8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cln5Q3UMW8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cln5Q3UMW8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cln5Q3UMW8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cln5Q3UMW8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cln5Q3UMW8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cln5Q3UMW8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cln5Q3UMW8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cln5Q3UMW8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cln5Q3UMW8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cln5Q3UMW8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cln5Q3UMW8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cln5Q3UMW8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cln5Q3UMW8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cln5Q3UMW8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cln5Q3UMW8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cln5Q3UMW8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cln5Q3UMW8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cln5Q3UMW8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cln5Q3UMW8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cln5Q3UMW8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cln5Q3UMW8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cln5Q3UMW8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cln5Q3UMW8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cln5Q3UMW8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cln5Q3UMW8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cln5Q3UMW8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cln5Q3UMW8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cln5Q3UMW8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cln5Q3UMW8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cln5Q3UMW8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cln5Q3UMW8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cln5Q3UMW8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cln5Q3UMW8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cln5Q3UMW8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cln5Q3UMW8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cln5Q3UMW8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cln5Q3UMW8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cln5Q3UMW8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cln5Q3UMW8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cln5Q3UMW8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cln5Q3UMW8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cln5Q3UMW8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cln5Q3UMW8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cln5Q3UMW8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cln5Q3UMW8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cln5Q3UMW8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cln5Q3UMW8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cln5Q3UMW8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cln5Q3UMW8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Cln5Q3UMW8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cln5Q3UMW8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cln5Q3UMW8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cln5Q3UMW8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cln5Q3UMW8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cln5Q3UMW8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cln5Q3UMW8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cln5Q3UMW8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cln5Q3UMW8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cln5Q3UMW8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cln5Q3UMW8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cln5Q3UMW8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cln5Q3UMW8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cln5Q3UMW8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cln5Q3UMW8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cln5Q3UMW8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cln5Q3UMW8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cln5Q3UMW8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cln5Q3UMW8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cln5Q3UMW8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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