Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cobll1Q3UMF0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cobll1Q3UMF0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cobll1Q3UMF0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cobll1Q3UMF0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cobll1Q3UMF0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cobll1Q3UMF0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cobll1Q3UMF0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cobll1Q3UMF0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cobll1Q3UMF0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cobll1Q3UMF0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cobll1Q3UMF0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cobll1Q3UMF0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cobll1Q3UMF0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cobll1Q3UMF0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cobll1Q3UMF0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cobll1Q3UMF0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cobll1Q3UMF0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cobll1Q3UMF0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cobll1Q3UMF0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cobll1Q3UMF0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cobll1Q3UMF0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cobll1Q3UMF0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cobll1Q3UMF0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cobll1Q3UMF0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cobll1Q3UMF0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cobll1Q3UMF0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cobll1Q3UMF0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cobll1Q3UMF0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cobll1Q3UMF0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cobll1Q3UMF0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cobll1Q3UMF0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cobll1Q3UMF0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cobll1Q3UMF0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cobll1Q3UMF0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cobll1Q3UMF0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cobll1Q3UMF0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cobll1Q3UMF0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cobll1Q3UMF0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cobll1Q3UMF0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cobll1Q3UMF0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cobll1Q3UMF0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cobll1Q3UMF0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cobll1Q3UMF0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cobll1Q3UMF0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cobll1Q3UMF0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cobll1Q3UMF0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cobll1Q3UMF0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cobll1Q3UMF0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cobll1Q3UMF0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cobll1Q3UMF0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cobll1Q3UMF0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cobll1Q3UMF0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cobll1Q3UMF0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cobll1Q3UMF0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cobll1Q3UMF0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cobll1Q3UMF0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cobll1Q3UMF0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cobll1Q3UMF0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cobll1Q3UMF0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cobll1Q3UMF0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cobll1Q3UMF0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cobll1Q3UMF0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cobll1Q3UMF0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cobll1Q3UMF0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cobll1Q3UMF0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cobll1Q3UMF0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cobll1Q3UMF0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cobll1Q3UMF0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cobll1Q3UMF0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cobll1Q3UMF0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cobll1Q3UMF0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cobll1Q3UMF0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cobll1Q3UMF0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cobll1Q3UMF0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cobll1Q3UMF0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cobll1Q3UMF0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cobll1Q3UMF0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cobll1Q3UMF0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cobll1Q3UMF0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cobll1Q3UMF0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cobll1Q3UMF0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cobll1Q3UMF0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cobll1Q3UMF0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cobll1Q3UMF0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cobll1Q3UMF0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cobll1Q3UMF0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cobll1Q3UMF0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cobll1Q3UMF0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cobll1Q3UMF0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cobll1Q3UMF0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cobll1Q3UMF0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cobll1Q3UMF0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cobll1Q3UMF0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cobll1Q3UMF0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cobll1Q3UMF0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cobll1Q3UMF0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cobll1Q3UMF0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cobll1Q3UMF0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cobll1Q3UMF0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms