Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKP4

Ceacam12, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 12, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam12Q3UKP4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ceacam12Q3UKP4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ceacam12Q3UKP4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ceacam12Q3UKP4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ceacam12Q3UKP4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ceacam12Q3UKP4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ceacam12Q3UKP4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ceacam12Q3UKP4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ceacam12Q3UKP4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ceacam12Q3UKP4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ceacam12Q3UKP4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ceacam12Q3UKP4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ceacam12Q3UKP4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ceacam12Q3UKP4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ceacam12Q3UKP4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ceacam12Q3UKP4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ceacam12Q3UKP4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ceacam12Q3UKP4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ceacam12Q3UKP4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ceacam12Q3UKP4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ceacam12Q3UKP4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ceacam12Q3UKP4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ceacam12Q3UKP4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ceacam12Q3UKP4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ceacam12Q3UKP4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ceacam12Q3UKP4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ceacam12Q3UKP4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ceacam12Q3UKP4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ceacam12Q3UKP4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ceacam12Q3UKP4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ceacam12Q3UKP4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ceacam12Q3UKP4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ceacam12Q3UKP4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ceacam12Q3UKP4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ceacam12Q3UKP4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ceacam12Q3UKP4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ceacam12Q3UKP4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ceacam12Q3UKP4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ceacam12Q3UKP4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ceacam12Q3UKP4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ceacam12Q3UKP4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ceacam12Q3UKP4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ceacam12Q3UKP4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ceacam12Q3UKP4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ceacam12Q3UKP4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ceacam12Q3UKP4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ceacam12Q3UKP4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ceacam12Q3UKP4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ceacam12Q3UKP4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ceacam12Q3UKP4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ceacam12Q3UKP4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ceacam12Q3UKP4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ceacam12Q3UKP4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ceacam12Q3UKP4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ceacam12Q3UKP4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ceacam12Q3UKP4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ceacam12Q3UKP4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ceacam12Q3UKP4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ceacam12Q3UKP4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ceacam12Q3UKP4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ceacam12Q3UKP4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ceacam12Q3UKP4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ceacam12Q3UKP4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ceacam12Q3UKP4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ceacam12Q3UKP4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ceacam12Q3UKP4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ceacam12Q3UKP4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ceacam12Q3UKP4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ceacam12Q3UKP4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ceacam12Q3UKP4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ceacam12Q3UKP4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ceacam12Q3UKP4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ceacam12Q3UKP4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ceacam12Q3UKP4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ceacam12Q3UKP4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ceacam12Q3UKP4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ceacam12Q3UKP4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ceacam12Q3UKP4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ceacam12Q3UKP4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ceacam12Q3UKP4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ceacam12Q3UKP4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ceacam12Q3UKP4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ceacam12Q3UKP4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ceacam12Q3UKP4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ceacam12Q3UKP4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ceacam12Q3UKP4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ceacam12Q3UKP4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ceacam12Q3UKP4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ceacam12Q3UKP4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ceacam12Q3UKP4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ceacam12Q3UKP4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ceacam12Q3UKP4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ceacam12Q3UKP4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ceacam12Q3UKP4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ceacam12Q3UKP4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ceacam12Q3UKP4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ceacam12Q3UKP4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ceacam12Q3UKP4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ceacam12Q3UKP4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ceacam12Q3UKP4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms