Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Usp19Q3UJD6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Usp19Q3UJD6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Usp19Q3UJD6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Usp19Q3UJD6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Usp19Q3UJD6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Usp19Q3UJD6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Usp19Q3UJD6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Usp19Q3UJD6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Usp19Q3UJD6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Usp19Q3UJD6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Usp19Q3UJD6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Usp19Q3UJD6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Usp19Q3UJD6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Usp19Q3UJD6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Usp19Q3UJD6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Usp19Q3UJD6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Usp19Q3UJD6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Usp19Q3UJD6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Usp19Q3UJD6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Usp19Q3UJD6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Usp19Q3UJD6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Usp19Q3UJD6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Usp19Q3UJD6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Usp19Q3UJD6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Usp19Q3UJD6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Usp19Q3UJD6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Usp19Q3UJD6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Usp19Q3UJD6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Usp19Q3UJD6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Usp19Q3UJD6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Usp19Q3UJD6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Usp19Q3UJD6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Usp19Q3UJD6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Usp19Q3UJD6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Usp19Q3UJD6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Usp19Q3UJD6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Usp19Q3UJD6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Usp19Q3UJD6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Usp19Q3UJD6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Usp19Q3UJD6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Usp19Q3UJD6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Usp19Q3UJD6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Usp19Q3UJD6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Usp19Q3UJD6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Usp19Q3UJD6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Usp19Q3UJD6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Usp19Q3UJD6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Usp19Q3UJD6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Usp19Q3UJD6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Usp19Q3UJD6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Usp19Q3UJD6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Usp19Q3UJD6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Usp19Q3UJD6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Usp19Q3UJD6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Usp19Q3UJD6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Usp19Q3UJD6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Usp19Q3UJD6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Usp19Q3UJD6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Usp19Q3UJD6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Usp19Q3UJD6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Usp19Q3UJD6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Usp19Q3UJD6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Usp19Q3UJD6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Usp19Q3UJD6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp19Q3UJD6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp19Q3UJD6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp19Q3UJD6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp19Q3UJD6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp19Q3UJD6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp19Q3UJD6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp19Q3UJD6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp19Q3UJD6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Usp19Q3UJD6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Usp19Q3UJD6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Usp19Q3UJD6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Usp19Q3UJD6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Usp19Q3UJD6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Usp19Q3UJD6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Usp19Q3UJD6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Usp19Q3UJD6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Usp19Q3UJD6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Usp19Q3UJD6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Usp19Q3UJD6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Usp19Q3UJD6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Usp19Q3UJD6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Usp19Q3UJD6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Usp19Q3UJD6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Usp19Q3UJD6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Usp19Q3UJD6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Usp19Q3UJD6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Usp19Q3UJD6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Usp19Q3UJD6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Usp19Q3UJD6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Usp19Q3UJD6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Usp19Q3UJD6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Usp19Q3UJD6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Usp19Q3UJD6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Usp19Q3UJD6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Usp19Q3UJD6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms