Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sf3b2Q3UJB0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sf3b2Q3UJB0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sf3b2Q3UJB0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sf3b2Q3UJB0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sf3b2Q3UJB0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sf3b2Q3UJB0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sf3b2Q3UJB0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sf3b2Q3UJB0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sf3b2Q3UJB0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sf3b2Q3UJB0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sf3b2Q3UJB0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sf3b2Q3UJB0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sf3b2Q3UJB0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Sf3b2Q3UJB0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sf3b2Q3UJB0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sf3b2Q3UJB0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sf3b2Q3UJB0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sf3b2Q3UJB0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sf3b2Q3UJB0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Sf3b2Q3UJB0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sf3b2Q3UJB0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sf3b2Q3UJB0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sf3b2Q3UJB0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sf3b2Q3UJB0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sf3b2Q3UJB0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Sf3b2Q3UJB0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sf3b2Q3UJB0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sf3b2Q3UJB0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sf3b2Q3UJB0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sf3b2Q3UJB0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sf3b2Q3UJB0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sf3b2Q3UJB0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Sf3b2Q3UJB0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sf3b2Q3UJB0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Sf3b2Q3UJB0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sf3b2Q3UJB0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sf3b2Q3UJB0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sf3b2Q3UJB0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sf3b2Q3UJB0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sf3b2Q3UJB0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sf3b2Q3UJB0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Sf3b2Q3UJB0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sf3b2Q3UJB0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sf3b2Q3UJB0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Sf3b2Q3UJB0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sf3b2Q3UJB0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sf3b2Q3UJB0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sf3b2Q3UJB0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sf3b2Q3UJB0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Sf3b2Q3UJB0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Sf3b2Q3UJB0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Sf3b2Q3UJB0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sf3b2Q3UJB0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sf3b2Q3UJB0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sf3b2Q3UJB0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sf3b2Q3UJB0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sf3b2Q3UJB0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sf3b2Q3UJB0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sf3b2Q3UJB0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sf3b2Q3UJB0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sf3b2Q3UJB0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sf3b2Q3UJB0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sf3b2Q3UJB0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sf3b2Q3UJB0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sf3b2Q3UJB0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sf3b2Q3UJB0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sf3b2Q3UJB0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sf3b2Q3UJB0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sf3b2Q3UJB0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sf3b2Q3UJB0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sf3b2Q3UJB0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sf3b2Q3UJB0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sf3b2Q3UJB0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sf3b2Q3UJB0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sf3b2Q3UJB0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sf3b2Q3UJB0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sf3b2Q3UJB0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sf3b2Q3UJB0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sf3b2Q3UJB0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sf3b2Q3UJB0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sf3b2Q3UJB0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sf3b2Q3UJB0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sf3b2Q3UJB0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sf3b2Q3UJB0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sf3b2Q3UJB0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sf3b2Q3UJB0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sf3b2Q3UJB0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sf3b2Q3UJB0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Sf3b2Q3UJB0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Sf3b2Q3UJB0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sf3b2Q3UJB0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sf3b2Q3UJB0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sf3b2Q3UJB0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms