Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Zswim8Q3UHH1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Zswim8Q3UHH1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Zswim8Q3UHH1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Zswim8Q3UHH1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Zswim8Q3UHH1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Zswim8Q3UHH1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Zswim8Q3UHH1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Zswim8Q3UHH1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Zswim8Q3UHH1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Zswim8Q3UHH1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Zswim8Q3UHH1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Zswim8Q3UHH1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Zswim8Q3UHH1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Zswim8Q3UHH1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zswim8Q3UHH1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zswim8Q3UHH1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Zswim8Q3UHH1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Zswim8Q3UHH1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zswim8Q3UHH1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zswim8Q3UHH1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zswim8Q3UHH1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zswim8Q3UHH1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Zswim8Q3UHH1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zswim8Q3UHH1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Zswim8Q3UHH1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Zswim8Q3UHH1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Zswim8Q3UHH1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Zswim8Q3UHH1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Zswim8Q3UHH1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Zswim8Q3UHH1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Zswim8Q3UHH1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Zswim8Q3UHH1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Zswim8Q3UHH1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Zswim8Q3UHH1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Zswim8Q3UHH1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Zswim8Q3UHH1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Zswim8Q3UHH1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Zswim8Q3UHH1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Zswim8Q3UHH1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Zswim8Q3UHH1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Zswim8Q3UHH1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Zswim8Q3UHH1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Zswim8Q3UHH1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Zswim8Q3UHH1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Zswim8Q3UHH1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Zswim8Q3UHH1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Zswim8Q3UHH1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Zswim8Q3UHH1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Zswim8Q3UHH1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Zswim8Q3UHH1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Zswim8Q3UHH1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Zswim8Q3UHH1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Zswim8Q3UHH1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Zswim8Q3UHH1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Zswim8Q3UHH1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Zswim8Q3UHH1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Zswim8Q3UHH1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Zswim8Q3UHH1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Zswim8Q3UHH1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Zswim8Q3UHH1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Zswim8Q3UHH1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Zswim8Q3UHH1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Zswim8Q3UHH1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Zswim8Q3UHH1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Zswim8Q3UHH1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Zswim8Q3UHH1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Zswim8Q3UHH1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Zswim8Q3UHH1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Zswim8Q3UHH1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Zswim8Q3UHH1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Zswim8Q3UHH1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Zswim8Q3UHH1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Zswim8Q3UHH1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Zswim8Q3UHH1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Zswim8Q3UHH1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Zswim8Q3UHH1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zswim8Q3UHH1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zswim8Q3UHH1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zswim8Q3UHH1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zswim8Q3UHH1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zswim8Q3UHH1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zswim8Q3UHH1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zswim8Q3UHH1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zswim8Q3UHH1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Zswim8Q3UHH1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Zswim8Q3UHH1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Zswim8Q3UHH1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zswim8Q3UHH1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zswim8Q3UHH1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Zswim8Q3UHH1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Zswim8Q3UHH1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Zswim8Q3UHH1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Zswim8Q3UHH1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Zswim8Q3UHH1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zswim8Q3UHH1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zswim8Q3UHH1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zswim8Q3UHH1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zswim8Q3UHH1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zswim8Q3UHH1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.9 ms