Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc177Q3UHB8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc177Q3UHB8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc177Q3UHB8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc177Q3UHB8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc177Q3UHB8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc177Q3UHB8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc177Q3UHB8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc177Q3UHB8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc177Q3UHB8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc177Q3UHB8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc177Q3UHB8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc177Q3UHB8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc177Q3UHB8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc177Q3UHB8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc177Q3UHB8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc177Q3UHB8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc177Q3UHB8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc177Q3UHB8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc177Q3UHB8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc177Q3UHB8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc177Q3UHB8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc177Q3UHB8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc177Q3UHB8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc177Q3UHB8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc177Q3UHB8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc177Q3UHB8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc177Q3UHB8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc177Q3UHB8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc177Q3UHB8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc177Q3UHB8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc177Q3UHB8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc177Q3UHB8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc177Q3UHB8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc177Q3UHB8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc177Q3UHB8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc177Q3UHB8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc177Q3UHB8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc177Q3UHB8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc177Q3UHB8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc177Q3UHB8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc177Q3UHB8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc177Q3UHB8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc177Q3UHB8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc177Q3UHB8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc177Q3UHB8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc177Q3UHB8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc177Q3UHB8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc177Q3UHB8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc177Q3UHB8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc177Q3UHB8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc177Q3UHB8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc177Q3UHB8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc177Q3UHB8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc177Q3UHB8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc177Q3UHB8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc177Q3UHB8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc177Q3UHB8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc177Q3UHB8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc177Q3UHB8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc177Q3UHB8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc177Q3UHB8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc177Q3UHB8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc177Q3UHB8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc177Q3UHB8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc177Q3UHB8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc177Q3UHB8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc177Q3UHB8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc177Q3UHB8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc177Q3UHB8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc177Q3UHB8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc177Q3UHB8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc177Q3UHB8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc177Q3UHB8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc177Q3UHB8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc177Q3UHB8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc177Q3UHB8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc177Q3UHB8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc177Q3UHB8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc177Q3UHB8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc177Q3UHB8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc177Q3UHB8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc177Q3UHB8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc177Q3UHB8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc177Q3UHB8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc177Q3UHB8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc177Q3UHB8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc177Q3UHB8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc177Q3UHB8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc177Q3UHB8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc177Q3UHB8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc177Q3UHB8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc177Q3UHB8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc177Q3UHB8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc177Q3UHB8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc177Q3UHB8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc177Q3UHB8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc177Q3UHB8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc177Q3UHB8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc177Q3UHB8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.3 ms