Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rsph3aQ3UFY4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rsph3aQ3UFY4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rsph3aQ3UFY4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rsph3aQ3UFY4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rsph3aQ3UFY4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rsph3aQ3UFY4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rsph3aQ3UFY4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rsph3aQ3UFY4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rsph3aQ3UFY4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rsph3aQ3UFY4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rsph3aQ3UFY4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rsph3aQ3UFY4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rsph3aQ3UFY4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rsph3aQ3UFY4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rsph3aQ3UFY4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rsph3aQ3UFY4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rsph3aQ3UFY4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Rsph3aQ3UFY4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rsph3aQ3UFY4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rsph3aQ3UFY4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rsph3aQ3UFY4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rsph3aQ3UFY4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rsph3aQ3UFY4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rsph3aQ3UFY4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rsph3aQ3UFY4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rsph3aQ3UFY4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rsph3aQ3UFY4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rsph3aQ3UFY4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rsph3aQ3UFY4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rsph3aQ3UFY4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rsph3aQ3UFY4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rsph3aQ3UFY4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rsph3aQ3UFY4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rsph3aQ3UFY4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rsph3aQ3UFY4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rsph3aQ3UFY4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rsph3aQ3UFY4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rsph3aQ3UFY4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rsph3aQ3UFY4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rsph3aQ3UFY4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rsph3aQ3UFY4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rsph3aQ3UFY4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rsph3aQ3UFY4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rsph3aQ3UFY4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rsph3aQ3UFY4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rsph3aQ3UFY4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rsph3aQ3UFY4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rsph3aQ3UFY4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rsph3aQ3UFY4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rsph3aQ3UFY4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rsph3aQ3UFY4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rsph3aQ3UFY4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rsph3aQ3UFY4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rsph3aQ3UFY4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Rsph3aQ3UFY4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rsph3aQ3UFY4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rsph3aQ3UFY4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rsph3aQ3UFY4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rsph3aQ3UFY4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rsph3aQ3UFY4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rsph3aQ3UFY4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rsph3aQ3UFY4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rsph3aQ3UFY4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rsph3aQ3UFY4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rsph3aQ3UFY4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rsph3aQ3UFY4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rsph3aQ3UFY4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Rsph3aQ3UFY4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rsph3aQ3UFY4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rsph3aQ3UFY4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rsph3aQ3UFY4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Rsph3aQ3UFY4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rsph3aQ3UFY4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rsph3aQ3UFY4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rsph3aQ3UFY4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rsph3aQ3UFY4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rsph3aQ3UFY4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rsph3aQ3UFY4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rsph3aQ3UFY4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rsph3aQ3UFY4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rsph3aQ3UFY4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rsph3aQ3UFY4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Rsph3aQ3UFY4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rsph3aQ3UFY4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rsph3aQ3UFY4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rsph3aQ3UFY4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rsph3aQ3UFY4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rsph3aQ3UFY4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rsph3aQ3UFY4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rsph3aQ3UFY4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rsph3aQ3UFY4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rsph3aQ3UFY4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rsph3aQ3UFY4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rsph3aQ3UFY4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rsph3aQ3UFY4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rsph3aQ3UFY4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rsph3aQ3UFY4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rsph3aQ3UFY4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rsph3aQ3UFY4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms