Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6Q4

Pik3r6, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3r6Q3U6Q4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pik3r6Q3U6Q4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pik3r6Q3U6Q4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pik3r6Q3U6Q4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pik3r6Q3U6Q4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pik3r6Q3U6Q4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pik3r6Q3U6Q4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pik3r6Q3U6Q4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pik3r6Q3U6Q4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pik3r6Q3U6Q4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Pik3r6Q3U6Q4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pik3r6Q3U6Q4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pik3r6Q3U6Q4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pik3r6Q3U6Q4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pik3r6Q3U6Q4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pik3r6Q3U6Q4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pik3r6Q3U6Q4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pik3r6Q3U6Q4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pik3r6Q3U6Q4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pik3r6Q3U6Q4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pik3r6Q3U6Q4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pik3r6Q3U6Q4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pik3r6Q3U6Q4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pik3r6Q3U6Q4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pik3r6Q3U6Q4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pik3r6Q3U6Q4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pik3r6Q3U6Q4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Pik3r6Q3U6Q4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pik3r6Q3U6Q4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pik3r6Q3U6Q4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pik3r6Q3U6Q4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pik3r6Q3U6Q4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Pik3r6Q3U6Q4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pik3r6Q3U6Q4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pik3r6Q3U6Q4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pik3r6Q3U6Q4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pik3r6Q3U6Q4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pik3r6Q3U6Q4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pik3r6Q3U6Q4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pik3r6Q3U6Q4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pik3r6Q3U6Q4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pik3r6Q3U6Q4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pik3r6Q3U6Q4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pik3r6Q3U6Q4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pik3r6Q3U6Q4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pik3r6Q3U6Q4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pik3r6Q3U6Q4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pik3r6Q3U6Q4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pik3r6Q3U6Q4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pik3r6Q3U6Q4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pik3r6Q3U6Q4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms