Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ulk3Q3U3Q1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ulk3Q3U3Q1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ulk3Q3U3Q1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ulk3Q3U3Q1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ulk3Q3U3Q1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ulk3Q3U3Q1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ulk3Q3U3Q1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ulk3Q3U3Q1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ulk3Q3U3Q1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ulk3Q3U3Q1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ulk3Q3U3Q1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ulk3Q3U3Q1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ulk3Q3U3Q1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ulk3Q3U3Q1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ulk3Q3U3Q1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ulk3Q3U3Q1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ulk3Q3U3Q1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ulk3Q3U3Q1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ulk3Q3U3Q1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ulk3Q3U3Q1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ulk3Q3U3Q1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ulk3Q3U3Q1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ulk3Q3U3Q1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ulk3Q3U3Q1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ulk3Q3U3Q1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ulk3Q3U3Q1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ulk3Q3U3Q1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ulk3Q3U3Q1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ulk3Q3U3Q1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ulk3Q3U3Q1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ulk3Q3U3Q1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ulk3Q3U3Q1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ulk3Q3U3Q1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ulk3Q3U3Q1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ulk3Q3U3Q1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ulk3Q3U3Q1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ulk3Q3U3Q1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ulk3Q3U3Q1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ulk3Q3U3Q1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ulk3Q3U3Q1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ulk3Q3U3Q1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ulk3Q3U3Q1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ulk3Q3U3Q1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ulk3Q3U3Q1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ulk3Q3U3Q1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ulk3Q3U3Q1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ulk3Q3U3Q1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ulk3Q3U3Q1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ulk3Q3U3Q1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ulk3Q3U3Q1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ulk3Q3U3Q1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ulk3Q3U3Q1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ulk3Q3U3Q1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ulk3Q3U3Q1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ulk3Q3U3Q1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ulk3Q3U3Q1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ulk3Q3U3Q1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ulk3Q3U3Q1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ulk3Q3U3Q1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ulk3Q3U3Q1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ulk3Q3U3Q1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ulk3Q3U3Q1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ulk3Q3U3Q1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ulk3Q3U3Q1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ulk3Q3U3Q1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ulk3Q3U3Q1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ulk3Q3U3Q1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ulk3Q3U3Q1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ulk3Q3U3Q1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ulk3Q3U3Q1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ulk3Q3U3Q1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ulk3Q3U3Q1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ulk3Q3U3Q1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ulk3Q3U3Q1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ulk3Q3U3Q1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ulk3Q3U3Q1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ulk3Q3U3Q1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ulk3Q3U3Q1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ulk3Q3U3Q1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ulk3Q3U3Q1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ulk3Q3U3Q1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.1 ms