Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TchpQ3TVW5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TchpQ3TVW5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TchpQ3TVW5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TchpQ3TVW5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TchpQ3TVW5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TchpQ3TVW5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TchpQ3TVW5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TchpQ3TVW5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TchpQ3TVW5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TchpQ3TVW5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TchpQ3TVW5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TchpQ3TVW5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TchpQ3TVW5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TchpQ3TVW5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TchpQ3TVW5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TchpQ3TVW5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TchpQ3TVW5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TchpQ3TVW5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TchpQ3TVW5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TchpQ3TVW5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TchpQ3TVW5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TchpQ3TVW5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TchpQ3TVW5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TchpQ3TVW5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TchpQ3TVW5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TchpQ3TVW5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TchpQ3TVW5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TchpQ3TVW5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TchpQ3TVW5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TchpQ3TVW5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TchpQ3TVW5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TchpQ3TVW5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TchpQ3TVW5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TchpQ3TVW5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TchpQ3TVW5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TchpQ3TVW5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TchpQ3TVW5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TchpQ3TVW5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TchpQ3TVW5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TchpQ3TVW5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TchpQ3TVW5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TchpQ3TVW5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TchpQ3TVW5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TchpQ3TVW5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TchpQ3TVW5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TchpQ3TVW5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TchpQ3TVW5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TchpQ3TVW5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TchpQ3TVW5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TchpQ3TVW5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TchpQ3TVW5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TchpQ3TVW5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TchpQ3TVW5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TchpQ3TVW5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TchpQ3TVW5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TchpQ3TVW5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TchpQ3TVW5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TchpQ3TVW5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TchpQ3TVW5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TchpQ3TVW5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TchpQ3TVW5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TchpQ3TVW5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TchpQ3TVW5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TchpQ3TVW5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TchpQ3TVW5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TchpQ3TVW5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TchpQ3TVW5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TchpQ3TVW5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TchpQ3TVW5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TchpQ3TVW5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TchpQ3TVW5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TchpQ3TVW5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TchpQ3TVW5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TchpQ3TVW5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TchpQ3TVW5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TchpQ3TVW5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TchpQ3TVW5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TchpQ3TVW5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TchpQ3TVW5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TchpQ3TVW5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TchpQ3TVW5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TchpQ3TVW5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TchpQ3TVW5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TchpQ3TVW5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TchpQ3TVW5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TchpQ3TVW5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TchpQ3TVW5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TchpQ3TVW5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TchpQ3TVW5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TchpQ3TVW5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TchpQ3TVW5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TchpQ3TVW5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TchpQ3TVW5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TchpQ3TVW5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TchpQ3TVW5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TchpQ3TVW5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TchpQ3TVW5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TchpQ3TVW5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TchpQ3TVW5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms