Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxw18Q3TSA9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxw18Q3TSA9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxw18Q3TSA9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxw18Q3TSA9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Fbxw18Q3TSA9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fbxw18Q3TSA9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fbxw18Q3TSA9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxw18Q3TSA9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxw18Q3TSA9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxw18Q3TSA9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxw18Q3TSA9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxw18Q3TSA9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxw18Q3TSA9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxw18Q3TSA9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxw18Q3TSA9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxw18Q3TSA9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxw18Q3TSA9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxw18Q3TSA9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxw18Q3TSA9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxw18Q3TSA9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxw18Q3TSA9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxw18Q3TSA9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxw18Q3TSA9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxw18Q3TSA9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fbxw18Q3TSA9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fbxw18Q3TSA9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fbxw18Q3TSA9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fbxw18Q3TSA9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fbxw18Q3TSA9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fbxw18Q3TSA9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fbxw18Q3TSA9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fbxw18Q3TSA9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fbxw18Q3TSA9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fbxw18Q3TSA9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fbxw18Q3TSA9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fbxw18Q3TSA9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fbxw18Q3TSA9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fbxw18Q3TSA9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fbxw18Q3TSA9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fbxw18Q3TSA9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fbxw18Q3TSA9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fbxw18Q3TSA9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fbxw18Q3TSA9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Fbxw18Q3TSA9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fbxw18Q3TSA9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fbxw18Q3TSA9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fbxw18Q3TSA9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fbxw18Q3TSA9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fbxw18Q3TSA9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fbxw18Q3TSA9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fbxw18Q3TSA9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fbxw18Q3TSA9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fbxw18Q3TSA9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fbxw18Q3TSA9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fbxw18Q3TSA9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fbxw18Q3TSA9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fbxw18Q3TSA9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fbxw18Q3TSA9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fbxw18Q3TSA9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fbxw18Q3TSA9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fbxw18Q3TSA9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fbxw18Q3TSA9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fbxw18Q3TSA9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fbxw18Q3TSA9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fbxw18Q3TSA9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fbxw18Q3TSA9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fbxw18Q3TSA9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fbxw18Q3TSA9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Fbxw18Q3TSA9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fbxw18Q3TSA9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fbxw18Q3TSA9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fbxw18Q3TSA9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fbxw18Q3TSA9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fbxw18Q3TSA9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fbxw18Q3TSA9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fbxw18Q3TSA9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fbxw18Q3TSA9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fbxw18Q3TSA9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fbxw18Q3TSA9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fbxw18Q3TSA9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fbxw18Q3TSA9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fbxw18Q3TSA9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fbxw18Q3TSA9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fbxw18Q3TSA9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fbxw18Q3TSA9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fbxw18Q3TSA9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fbxw18Q3TSA9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fbxw18Q3TSA9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fbxw18Q3TSA9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fbxw18Q3TSA9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fbxw18Q3TSA9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fbxw18Q3TSA9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fbxw18Q3TSA9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fbxw18Q3TSA9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fbxw18Q3TSA9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fbxw18Q3TSA9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fbxw18Q3TSA9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fbxw18Q3TSA9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fbxw18Q3TSA9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms