Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q3TQQ9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q3TQQ9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q3TQQ9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q3TQQ9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Q3TQQ9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q3TQQ9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q3TQQ9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q3TQQ9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q3TQQ9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q3TQQ9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q3TQQ9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q3TQQ9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q3TQQ9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3TQQ9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3TQQ9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3TQQ9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3TQQ9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3TQQ9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Q3TQQ9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q3TQQ9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q3TQQ9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q3TQQ9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q3TQQ9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q3TQQ9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q3TQQ9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q3TQQ9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q3TQQ9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q3TQQ9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q3TQQ9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q3TQQ9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Q3TQQ9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q3TQQ9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3TQQ9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3TQQ9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3TQQ9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3TQQ9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3TQQ9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3TQQ9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3TQQ9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3TQQ9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q3TQQ9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Q3TQQ9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q3TQQ9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q3TQQ9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q3TQQ9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q3TQQ9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q3TQQ9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q3TQQ9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q3TQQ9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3TQQ9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3TQQ9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3TQQ9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3TQQ9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3TQQ9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3TQQ9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3TQQ9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3TQQ9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3TQQ9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3TQQ9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Q3TQQ9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Q3TQQ9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q3TQQ9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q3TQQ9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q3TQQ9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q3TQQ9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q3TQQ9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3TQQ9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3TQQ9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3TQQ9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3TQQ9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3TQQ9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3TQQ9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3TQQ9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3TQQ9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3TQQ9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3TQQ9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3TQQ9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3TQQ9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3TQQ9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3TQQ9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3TQQ9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3TQQ9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3TQQ9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3TQQ9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3TQQ9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3TQQ9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3TQQ9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3TQQ9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q3TQQ9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q3TQQ9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Q3TQQ9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q3TQQ9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q3TQQ9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Q3TQQ9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q3TQQ9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q3TQQ9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q3TQQ9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q3TQQ9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q3TQQ9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms