Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Ccdc102aQ3TMW1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc102aQ3TMW1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc102aQ3TMW1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc102aQ3TMW1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc102aQ3TMW1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc102aQ3TMW1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc102aQ3TMW1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc102aQ3TMW1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc102aQ3TMW1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc102aQ3TMW1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc102aQ3TMW1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc102aQ3TMW1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc102aQ3TMW1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc102aQ3TMW1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc102aQ3TMW1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc102aQ3TMW1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc102aQ3TMW1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc102aQ3TMW1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc102aQ3TMW1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc102aQ3TMW1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc102aQ3TMW1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc102aQ3TMW1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc102aQ3TMW1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc102aQ3TMW1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc102aQ3TMW1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc102aQ3TMW1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc102aQ3TMW1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc102aQ3TMW1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc102aQ3TMW1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc102aQ3TMW1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc102aQ3TMW1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc102aQ3TMW1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc102aQ3TMW1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc102aQ3TMW1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc102aQ3TMW1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc102aQ3TMW1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc102aQ3TMW1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc102aQ3TMW1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc102aQ3TMW1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc102aQ3TMW1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc102aQ3TMW1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc102aQ3TMW1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc102aQ3TMW1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc102aQ3TMW1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc102aQ3TMW1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc102aQ3TMW1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc102aQ3TMW1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc102aQ3TMW1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc102aQ3TMW1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc102aQ3TMW1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc102aQ3TMW1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc102aQ3TMW1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc102aQ3TMW1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc102aQ3TMW1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc102aQ3TMW1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc102aQ3TMW1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc102aQ3TMW1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc102aQ3TMW1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc102aQ3TMW1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc102aQ3TMW1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc102aQ3TMW1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc102aQ3TMW1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc102aQ3TMW1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc102aQ3TMW1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc102aQ3TMW1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc102aQ3TMW1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc102aQ3TMW1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc102aQ3TMW1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc102aQ3TMW1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc102aQ3TMW1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc102aQ3TMW1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc102aQ3TMW1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc102aQ3TMW1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc102aQ3TMW1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc102aQ3TMW1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc102aQ3TMW1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc102aQ3TMW1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc102aQ3TMW1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc102aQ3TMW1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc102aQ3TMW1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms