Protein–RNA interactions for Protein: Q3LAC4

Prex2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prex2Q3LAC4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Prex2Q3LAC4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Prex2Q3LAC4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Prex2Q3LAC4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Prex2Q3LAC4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Prex2Q3LAC4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Prex2Q3LAC4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Prex2Q3LAC4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Prex2Q3LAC4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Prex2Q3LAC4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Prex2Q3LAC4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Prex2Q3LAC4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Prex2Q3LAC4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Prex2Q3LAC4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Prex2Q3LAC4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Prex2Q3LAC4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Prex2Q3LAC4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Prex2Q3LAC4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Prex2Q3LAC4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Prex2Q3LAC4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Prex2Q3LAC4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Prex2Q3LAC4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Prex2Q3LAC4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Prex2Q3LAC4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Prex2Q3LAC4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Prex2Q3LAC4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Prex2Q3LAC4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Prex2Q3LAC4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Prex2Q3LAC4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Prex2Q3LAC4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Prex2Q3LAC4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Prex2Q3LAC4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Prex2Q3LAC4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Prex2Q3LAC4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Prex2Q3LAC4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Prex2Q3LAC4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Prex2Q3LAC4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Prex2Q3LAC4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Prex2Q3LAC4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Prex2Q3LAC4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Prex2Q3LAC4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Prex2Q3LAC4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Prex2Q3LAC4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Prex2Q3LAC4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Prex2Q3LAC4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Prex2Q3LAC4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Prex2Q3LAC4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Prex2Q3LAC4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Prex2Q3LAC4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Prex2Q3LAC4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
Prex2Q3LAC4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Prex2Q3LAC4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Prex2Q3LAC4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Prex2Q3LAC4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Prex2Q3LAC4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Prex2Q3LAC4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Prex2Q3LAC4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Prex2Q3LAC4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Prex2Q3LAC4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Prex2Q3LAC4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Prex2Q3LAC4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Prex2Q3LAC4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Prex2Q3LAC4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Prex2Q3LAC4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Prex2Q3LAC4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Prex2Q3LAC4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Prex2Q3LAC4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Prex2Q3LAC4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Prex2Q3LAC4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Prex2Q3LAC4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Prex2Q3LAC4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Prex2Q3LAC4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Prex2Q3LAC4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Prex2Q3LAC4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Prex2Q3LAC4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Prex2Q3LAC4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Prex2Q3LAC4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Prex2Q3LAC4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Prex2Q3LAC4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Prex2Q3LAC4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Prex2Q3LAC4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Prex2Q3LAC4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Prex2Q3LAC4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Prex2Q3LAC4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Prex2Q3LAC4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Prex2Q3LAC4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Prex2Q3LAC4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Prex2Q3LAC4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Prex2Q3LAC4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Prex2Q3LAC4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Prex2Q3LAC4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Prex2Q3LAC4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Prex2Q3LAC4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Prex2Q3LAC4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Prex2Q3LAC4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Prex2Q3LAC4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Prex2Q3LAC4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Prex2Q3LAC4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Prex2Q3LAC4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Prex2Q3LAC4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms