Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Samd11Q1RNF8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Samd11Q1RNF8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Samd11Q1RNF8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Samd11Q1RNF8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Samd11Q1RNF8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Samd11Q1RNF8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Samd11Q1RNF8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Samd11Q1RNF8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Samd11Q1RNF8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Samd11Q1RNF8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Samd11Q1RNF8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Samd11Q1RNF8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Samd11Q1RNF8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Samd11Q1RNF8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Samd11Q1RNF8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Samd11Q1RNF8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Samd11Q1RNF8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Samd11Q1RNF8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Samd11Q1RNF8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Samd11Q1RNF8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Samd11Q1RNF8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Samd11Q1RNF8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Samd11Q1RNF8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Samd11Q1RNF8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Samd11Q1RNF8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Samd11Q1RNF8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Samd11Q1RNF8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Samd11Q1RNF8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Samd11Q1RNF8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Samd11Q1RNF8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Samd11Q1RNF8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Samd11Q1RNF8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Samd11Q1RNF8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Samd11Q1RNF8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Samd11Q1RNF8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Samd11Q1RNF8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Samd11Q1RNF8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
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