Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBK2

Krt80, Keratin, type II cytoskeletal 80, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt80Q0VBK2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt80Q0VBK2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt80Q0VBK2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt80Q0VBK2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt80Q0VBK2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt80Q0VBK2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt80Q0VBK2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt80Q0VBK2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt80Q0VBK2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt80Q0VBK2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt80Q0VBK2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt80Q0VBK2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt80Q0VBK2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt80Q0VBK2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt80Q0VBK2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt80Q0VBK2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt80Q0VBK2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt80Q0VBK2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt80Q0VBK2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt80Q0VBK2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt80Q0VBK2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt80Q0VBK2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt80Q0VBK2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt80Q0VBK2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt80Q0VBK2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt80Q0VBK2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt80Q0VBK2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt80Q0VBK2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt80Q0VBK2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt80Q0VBK2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt80Q0VBK2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt80Q0VBK2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt80Q0VBK2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt80Q0VBK2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt80Q0VBK2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt80Q0VBK2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt80Q0VBK2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt80Q0VBK2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt80Q0VBK2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt80Q0VBK2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt80Q0VBK2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt80Q0VBK2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt80Q0VBK2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt80Q0VBK2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt80Q0VBK2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt80Q0VBK2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt80Q0VBK2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt80Q0VBK2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt80Q0VBK2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt80Q0VBK2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt80Q0VBK2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt80Q0VBK2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt80Q0VBK2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt80Q0VBK2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt80Q0VBK2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt80Q0VBK2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Krt80Q0VBK2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Krt80Q0VBK2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Krt80Q0VBK2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Krt80Q0VBK2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt80Q0VBK2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt80Q0VBK2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt80Q0VBK2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt80Q0VBK2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt80Q0VBK2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt80Q0VBK2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt80Q0VBK2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt80Q0VBK2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt80Q0VBK2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt80Q0VBK2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt80Q0VBK2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt80Q0VBK2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt80Q0VBK2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt80Q0VBK2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt80Q0VBK2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt80Q0VBK2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt80Q0VBK2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt80Q0VBK2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt80Q0VBK2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt80Q0VBK2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt80Q0VBK2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt80Q0VBK2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt80Q0VBK2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt80Q0VBK2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt80Q0VBK2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt80Q0VBK2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt80Q0VBK2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt80Q0VBK2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt80Q0VBK2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt80Q0VBK2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt80Q0VBK2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt80Q0VBK2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt80Q0VBK2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Krt80Q0VBK2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt80Q0VBK2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt80Q0VBK2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt80Q0VBK2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt80Q0VBK2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt80Q0VBK2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt80Q0VBK2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms