Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem52bQ0VBF2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem52bQ0VBF2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem52bQ0VBF2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem52bQ0VBF2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem52bQ0VBF2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem52bQ0VBF2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem52bQ0VBF2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem52bQ0VBF2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem52bQ0VBF2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem52bQ0VBF2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem52bQ0VBF2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem52bQ0VBF2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem52bQ0VBF2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem52bQ0VBF2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem52bQ0VBF2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem52bQ0VBF2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem52bQ0VBF2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem52bQ0VBF2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem52bQ0VBF2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem52bQ0VBF2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem52bQ0VBF2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem52bQ0VBF2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem52bQ0VBF2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms