Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab42Q0PD08 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab42Q0PD08 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab42Q0PD08 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab42Q0PD08 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab42Q0PD08 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab42Q0PD08 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rab42Q0PD08 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab42Q0PD08 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab42Q0PD08 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab42Q0PD08 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab42Q0PD08 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab42Q0PD08 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab42Q0PD08 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab42Q0PD08 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab42Q0PD08 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab42Q0PD08 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab42Q0PD08 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab42Q0PD08 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab42Q0PD08 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab42Q0PD08 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab42Q0PD08 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab42Q0PD08 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab42Q0PD08 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab42Q0PD08 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab42Q0PD08 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab42Q0PD08 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab42Q0PD08 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab42Q0PD08 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab42Q0PD08 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab42Q0PD08 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab42Q0PD08 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab42Q0PD08 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab42Q0PD08 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab42Q0PD08 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab42Q0PD08 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab42Q0PD08 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab42Q0PD08 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab42Q0PD08 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab42Q0PD08 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab42Q0PD08 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab42Q0PD08 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab42Q0PD08 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab42Q0PD08 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab42Q0PD08 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab42Q0PD08 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab42Q0PD08 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab42Q0PD08 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab42Q0PD08 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab42Q0PD08 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab42Q0PD08 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab42Q0PD08 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab42Q0PD08 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab42Q0PD08 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab42Q0PD08 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab42Q0PD08 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab42Q0PD08 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab42Q0PD08 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab42Q0PD08 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab42Q0PD08 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab42Q0PD08 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab42Q0PD08 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab42Q0PD08 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab42Q0PD08 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab42Q0PD08 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab42Q0PD08 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab42Q0PD08 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab42Q0PD08 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab42Q0PD08 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab42Q0PD08 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab42Q0PD08 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab42Q0PD08 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab42Q0PD08 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab42Q0PD08 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab42Q0PD08 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab42Q0PD08 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab42Q0PD08 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab42Q0PD08 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab42Q0PD08 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab42Q0PD08 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab42Q0PD08 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab42Q0PD08 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab42Q0PD08 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab42Q0PD08 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab42Q0PD08 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab42Q0PD08 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab42Q0PD08 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab42Q0PD08 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab42Q0PD08 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab42Q0PD08 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab42Q0PD08 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab42Q0PD08 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab42Q0PD08 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab42Q0PD08 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab42Q0PD08 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab42Q0PD08 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab42Q0PD08 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab42Q0PD08 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab42Q0PD08 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab42Q0PD08 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.3 ms