Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC32,76■■■□□ 2,83
Vps8Q0P5W1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC32,76■■■□□ 2,83
Vps8Q0P5W1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
Vps8Q0P5W1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
Vps8Q0P5W1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
Vps8Q0P5W1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
Vps8Q0P5W1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
Vps8Q0P5W1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
Vps8Q0P5W1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
Vps8Q0P5W1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC32,74■■■□□ 2,83
Vps8Q0P5W1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
Vps8Q0P5W1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC32,74■■■□□ 2,83
Vps8Q0P5W1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
Vps8Q0P5W1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
Vps8Q0P5W1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
Vps8Q0P5W1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,73■■■□□ 2,83
Vps8Q0P5W1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,73■■■□□ 2,83
Vps8Q0P5W1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,73■■■□□ 2,83
Vps8Q0P5W1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,73■■■□□ 2,83
Vps8Q0P5W1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,73■■■□□ 2,83
Vps8Q0P5W1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32,72■■■□□ 2,83
Vps8Q0P5W1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,71■■■□□ 2,83
Vps8Q0P5W1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC32,71■■■□□ 2,83
Vps8Q0P5W1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,71■■■□□ 2,83
Vps8Q0P5W1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,7■■■□□ 2,83
Vps8Q0P5W1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,7■■■□□ 2,83
Vps8Q0P5W1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC32,7■■■□□ 2,83
Vps8Q0P5W1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Vps8Q0P5W1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC32,68■■■□□ 2,82
Vps8Q0P5W1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,68■■■□□ 2,82
Vps8Q0P5W1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC32,68■■■□□ 2,82
Vps8Q0P5W1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,68■■■□□ 2,82
Vps8Q0P5W1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,68■■■□□ 2,82
Vps8Q0P5W1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC32,68■■■□□ 2,82
Vps8Q0P5W1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC32,68■■■□□ 2,82
Vps8Q0P5W1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,68■■■□□ 2,82
Vps8Q0P5W1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC32,67■■■□□ 2,82
Vps8Q0P5W1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC32,67■■■□□ 2,82
Vps8Q0P5W1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,66■■■□□ 2,82
Vps8Q0P5W1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
Vps8Q0P5W1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
Vps8Q0P5W1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
Vps8Q0P5W1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
Vps8Q0P5W1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
Vps8Q0P5W1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC32,65■■■□□ 2,82
Vps8Q0P5W1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC32,65■■■□□ 2,82
Vps8Q0P5W1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,64■■■□□ 2,82
Vps8Q0P5W1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC32,64■■■□□ 2,82
Vps8Q0P5W1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,63■■■□□ 2,81
Vps8Q0P5W1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,63■■■□□ 2,81
Vps8Q0P5W1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,63■■■□□ 2,81
Vps8Q0P5W1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC32,63■■■□□ 2,81
Vps8Q0P5W1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC32,63■■■□□ 2,81
Vps8Q0P5W1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
Vps8Q0P5W1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
Vps8Q0P5W1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC32,62■■■□□ 2,81
Vps8Q0P5W1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
Vps8Q0P5W1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
Vps8Q0P5W1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,61■■■□□ 2,81
Vps8Q0P5W1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Vps8Q0P5W1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,61■■■□□ 2,81
Vps8Q0P5W1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Vps8Q0P5W1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Vps8Q0P5W1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC32,61■■■□□ 2,81
Vps8Q0P5W1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Vps8Q0P5W1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Vps8Q0P5W1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,6■■■□□ 2,81
Vps8Q0P5W1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,6■■■□□ 2,81
Vps8Q0P5W1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC32,6■■■□□ 2,81
Vps8Q0P5W1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC32,59■■■□□ 2,81
Vps8Q0P5W1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,59■■■□□ 2,81
Vps8Q0P5W1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC32,59■■■□□ 2,81
Vps8Q0P5W1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,59■■■□□ 2,81
Vps8Q0P5W1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Vps8Q0P5W1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Vps8Q0P5W1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32,57■■■□□ 2,8
Vps8Q0P5W1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC32,57■■■□□ 2,8
Vps8Q0P5W1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32,57■■■□□ 2,8
Vps8Q0P5W1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32,57■■■□□ 2,8
Vps8Q0P5W1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,57■■■□□ 2,8
Vps8Q0P5W1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
Vps8Q0P5W1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
Vps8Q0P5W1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
Vps8Q0P5W1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32,55■■■□□ 2,8
Vps8Q0P5W1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
Vps8Q0P5W1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC32,55■■■□□ 2,8
Vps8Q0P5W1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
Vps8Q0P5W1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
Vps8Q0P5W1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Vps8Q0P5W1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Vps8Q0P5W1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC32,54■■■□□ 2,8
Vps8Q0P5W1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Vps8Q0P5W1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Vps8Q0P5W1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Vps8Q0P5W1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Vps8Q0P5W1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,8
Vps8Q0P5W1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,79
Vps8Q0P5W1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC32,51■■■□□ 2,79
Vps8Q0P5W1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,79
Vps8Q0P5W1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14,8 ms